染色体脆弱部位FRA3Bとパリンドローム不安定性

2014 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25860256
• 研究機関: 藤田保健衛生大学
• 研究代表者: 加藤 武馬 藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 助教 (20387690)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2015-03-31
• キーワード: PATRR / 染色体転座 / パリンドローム

研究実績の概要

パリンドローム配列が染色体の構造異常を誘発することが知られており、パリンドローム配列を介した染色体転座がt(11;22)(q23;q11)をはじめとして数多く報告されている。両転座染色体上の切断点には、数百塩基対のPalindromic AT-Rich Repeats (PATRRs)と呼ばれる配列が存在しており、PATRRのゲノム不安定性が染色体転座を誘発していると考えられている。PATRRはその配列の特性から、PCRやクローニングの困難な配列であるため、データベースに全長の配列が登録されておらず、切断点の解析が困難である。本研究では、t(8;22)(q24;q11)転座の切断点の解析を目的として、8番染色体のPATRR配列の全長を含むPCR産物を、次世代シーケンサーを用いてdeep sequenceすることで解読に成功し、多くの多型の存在を同定した。次に非血縁の2症例のt(8;22)転座の結合部を解析したところ、以前に報告されたt(8;22)転座とほぼ同じ切断点を持つ、PATRRを介した反復性転座であった。転座切断点は対称型PATRRの中央部であり、小さな欠失を伴って、マイクロホモロジーを介して結合していた。面白いことに、der(8)とder(22)を比較すると、結合部の配列が完全に同一であることが分かった。この結果より、 本来独立して発生するはずのder(8)とder(22)が、互いに協調しながら発生したことが推測される。以上より、PATRRを介した染色体転座は、十字架型の2次構造を形成したPATRR同士が染色体の切断を介さずに先行して結合し、 そのあと切断され2種類の派生染色体が発生するという新しいメカニズムを提唱した。

研究成果

• [雑誌論文] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: Mishra D, Kato T, Inagaki H, Kosho T, Wakui K, Kido Y, Sakazume S, Taniguchi-Ikeda M, Morisada N, Iijima K, Fukushima Y, Emanuel BS, Kurahashi H.
  • 雑誌名: Molecular cytogenetics 巻: 7 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1186/s13039-014-0055-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prevalence of Emanuel syndrome: theoretical frequency and surveillance result (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohye T, Inagaki H, Kato T, Tsutsumi M, Kurahashi H.
  • 雑誌名: Pediatrics International 巻: 56 ページ: 462-466
  • DOI: 10.1111/ped.12437.
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Analysis of the t(3;8) of hereditary renal cell carcinoma: a palindrome-mediated translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato T, Franconi CP, Sheridan MB Hacker AM, Inagakai H, Glover TW, Arlt MF, Drabkin HA, Gemmill RM, Kurahashi H, Emanuel BS
  • 雑誌名: Cancer Genetics 巻: 207 ページ: 133-140
  • DOI: 10.1016/j.cancergen.2014.03.004.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Age-related decrease of meiotic cohesins in human oocytes (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi M, Fujiwara R, Nishizawa H, Ito M, Kogo H, Inagaki H, Ohye T, Kato T, Fujii T, Kurahashi H.
  • 雑誌名: PLos One 巻: 9 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0096710
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤武馬、Divya Mishra、稲垣秀人、 池田真理子、森貞直哉、飯島一誠、城戸康宏、坂爪悟、古庄知己、涌井敬子、福嶋義光、倉橋浩樹
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤武馬、Divya Mishra、稲垣秀人、 池田真理子、森貞直哉、飯島一誠、城戸康宏、坂爪悟、古庄知己、涌井敬子、福嶋義光、倉橋浩樹
  • 学会等名: 第59回日本人類遺伝学会 第21回日本遺伝子診療学会 合同大会
  • 発表場所: タワーホール船堀
  • 年月日: 2014-11-19 – 2014-11-22
• [学会発表] ヒトゲノムに散在するパリンドローム配列の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 加藤武馬、稲垣秀人、大内雄矢、倉橋浩樹
  • 学会等名: 新学術「ゲノム支援」拡大班会議
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル
  • 年月日: 2014-08-20 – 2014-08-21