研究課題
本研究では、マウス初期発生段階における経時的エピジェネティックプロファイルを作成することにより、胎仔側、胎盤側それぞれ の細胞系列分化の評価系となりうるゲノム領域(シスエレメント)を網羅化し、特に分子生物学的知見に乏しい胎盤側の発生、分化に 関わる機能的ゲノム領域の新規同定を試みる。昨年度に引き続き、2細胞期胚 (2C)、胚性幹 (Embryonic Stem: ES)細胞および栄養膜幹 (Trophoblast Stem: TS)細胞それぞれにおいて、エピゲノム情報としてChIP-seq、FAIRE (Formaldehyde-Assisted Isolation of Regulatory Elements)-seqに加え3C (Chromosome conformation capture) assay データを取得した。2C-ES-TS間での比較からは多数の異なる遺伝子座凝集状態が観察され、これらは局所的なクロマチン構造のみならず、大小さまざまなドメイン形成を介して染色体の大部分が異なった空間構造をとっていることが示唆された。特にTSでは、転写制御領域と考えられているオープンクロマチン領域が非プロモーター領域を中心にESの2倍近く分布しており、それらを挟むH3K4モノメチル化修飾の特徴的な二峰性ピークが観察されたことから、TS特異的に検出されたオープンクロマチン領域の多くが近位あるいは遠位エンハンサーとして機能することが示唆された。これらのオープンクロマチン領域のなかには、胚体外系列の発生に必須でありその起点とも考えられているTead4のプロモーター領域とインタラクションするゲノム領域が含まれており、in vitroプロモーターアッセイの結果から、胚体外系列特異的なTead4エンハンサーとして機能する領域を、プロモーターと同一染色体上および異なる染色体上に複数同定した。ゲノム編集によりそれらのエンハンサー領域を欠損したマウスを作製し、個体発生レベルでの機能解析を進めている。
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すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)
Neuroendocrinology
巻: 未定 ページ: 未定
10.1159/000445207
