| 研究課題/領域番号 |
25861986
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| 研究機関 | 富山大学 |
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研究代表者 |
藤原 久美子 富山大学, 大学病院, 助教 (60404737)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 口蓋裂 / 遺伝子 |
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| 研究実績の概要 |
昨年度より富山大学医学部歯科口腔外科学講座に所属が変わったため、対象研究群として、富山大学附属病院で加療を行う口唇口蓋裂患者に関するサンプル取集を行ってきた。現在のところ、当大学でのサンプル約10例に関しては、手術時に生じた皮膚および粘膜の一部をQUAGEN Allprotect Tissue Reagent液に速やかに保存した状態である。またそれぞれについての患者の裂型・性別・既往歴・家族歴などの患者背景は、データとして保存し、サンプルとデータについては連結匿名化を実施し、得られた結果に応じて患者データにアクセス可能な状態とする。また実験室のセットアップについてもほぼ準備が整った状態である。
現在までに、本大学でえられたサンプルで、口蓋裂の孤発例と思われるものは3例にとどまっていた。そのため、今後の研究では無症候性の口蓋裂だけでなく、無症候性の口唇口蓋裂症例も含めて検討する方がのぞましいと思われた。
ＤＮＡ抽出後のＭＬＰＡ法実施に関しては、直接ＦＡＬＣＯバイオシステムズに問い合わせし、解析キットを本年度の予算で購入している。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
所属大学の移動のために、研究対象とするサンプルの収集開始から行う必要となった。また新たな研究室における実験の準備や試薬および備品の調整に時間が必要であった。
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| 今後の研究の推進方策 |
MLPA 法（Multiplex Ligation Probe Amplification）は、ターゲット領域にプローブを設定し、プローブが相補的な配列にハイブリダイズ可能な場合にのみPCR 産物が得られる解析手法である。PCR を利用するために少量のDNA での解析が可能なことと、ハイブリザイゼーションとライゲーションを行うために1 塩基の差異を解析することができる。1 組の共通PCR プライマーを用い、1 サンプルで最大50 領域までのマルチプレックスPCR を行う。増幅産物をシークエンサーで分離し、各増幅断片が示すピーク面積値を、それぞれのコントロールデータと比較することで、ターゲット領域の数的変化を検出することができる。これらの手順についてはＤＮＡ抽出後はすみやかに実施可能なため、随時実施していく。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本年度ではサンプルが10サンプル程度だったため、それほど試薬が必要ではなかった。キットは使用期限があるため、次年度以降のサンプル解析については購入しなかった。
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| 次年度使用額の使用計画 |
次年度にＭＬＰＡキットの追加購入など必要となると考えられるため。またサンプル採取の手法についても再検討を要する部分があるため、新たな採取キットの予算として使用する予定である。（唾液からの採取等）
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