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2015 年度 研究成果報告書

強力なゲノムワイド遺伝子×遺伝子および遺伝子×環境相互作用解析法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号 25870074
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 統計科学
人類遺伝学
研究機関久留米大学 (2015)
東北大学 (2013-2014)

研究代表者

植木 優夫  久留米大学, バイオ統計センター, 准教授 (10515860)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2016-03-31
キーワード遺伝的相互作用解析 / ゲノムワイド関連解析
研究成果の概要

ゲノムワイド関連解析(GWAS)における一塩基多型(SNP)データに対し、遺伝子x遺伝子相互作用、あるいは遺伝子×環境相互作用解析のための統計手法は充分に整備されていない。本課題においては、相互作用の検定において、自由度を分割表の観察頻度に応じて適応的に変化させる強力な検定手法を開発した。さらに、遺伝的予測問題において、次世代シーケンシングデータのような大規模データであっても迅速に実行可能で、なおかつ高精度なスパースモデリング手法、smooth-threshold multivariate genetic prediction (STMGP)法を開発した。

自由記述の分野

遺伝疫学、統計遺伝学

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公開日: 2017-05-10  

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