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2016年度は、2015年度までの成果に基づき、大量に林内に残された伊勢湾台風による風倒木が、様々な生物群集に与える影響について調べた。倒木中の菌類群集のメタバーコーディングによる解析によって、伊勢湾台風由来の腐朽度４の倒木では、比較的新しい腐朽度２の倒木に比べて、植物根と菌根共生関係にあるような菌種が多く検出された。また倒木の脂肪酸分析によって、腐朽が進んだ材ほど細菌由来の脂肪酸の割合が高かった。細菌由来の脂肪酸の中でも脂肪酸16:1w7cはリターや土壌と比べても、腐朽の進んだ材で特に高かった。この脂肪酸16:1w7cを倒木の餌資源としてのマーカーに使える可能性がある。
研究期間全体を通じて、本州における観測史上最大級の台風「伊勢湾台風」（1959年）による風倒が、約60年後の森林の炭素蓄積と森林動態に与える影響を明らかとなった。空中写真による分析によって、北八ヶ岳麦草峠周辺では解析対象範囲2093ha中299ha（14%）が壊滅的な風倒があり、そのうち241haから風倒木の搬出があった。これらの風倒地（倒木除去区・残置区）および非風倒地に森林調査区を設け、森林の炭素蓄積量を調べたところ、生立木は除去区と残置区に差はほとんどなく、非風倒地の約74%であった。倒木量は残置区は、非風倒地の3.4倍、除去区の6.3倍であり、林分全体（地下部を除く）の炭素蓄積量としては、残置区と非風倒地がほぼ同じで約120 t/haであったのに対し、除去区は88 t/haであった。つまり、現在の風倒残置区はその倒木の炭素蓄積の多さのために、老齢林とほぼ同等の炭素を蓄積しており、約60年前に行った風倒木の除去によって現在でも森林の炭素蓄積は約27％も減少していた。実生の密度は倒木残置区に比べ除去区で低くかった。半世紀以上前の倒木除去が、今後の長期的な森林動態にも大きな影響を与えると考えられた。
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