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2014 年度 研究成果報告書

腫瘍組織におけるゲノム不安定性に寄与する可動因子の同定

研究課題

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研究課題/領域番号 25870298
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 実験病理学
腫瘍生物学
研究機関浜松医科大学

研究代表者

華表 友暁  浜松医科大学, 医学部, 助教 (40416665)

研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2015-03-31
キーワードがん / ゲノム / 遺伝性疾患 / 内在性レトロウイルス / 高速DNAシーケンス / レトロトランスポゾン / 変異
研究成果の概要

可動因子であるヒト内在性レトロウイルス(HERV)の挙動を調べることで腫瘍組織のゲノム不安定性を議論することは、その反復配列としての性質上技術的に困難であった。本研究では、HERVに隣接する領域をinverse PCR法で増幅させて高速DNAシーケンサーで解読することで、効率的にHERV部位を同定する手法を開発した。HML2グループのLTR領域を標的とした解析では、既知LTR領域の約50%を再現性高く同定することができた。また、腫瘍ゲノムにおいて新規LTR部位と推定される部位も複数同定することに成功し、これまで報告のなかった活性型HERVの存在と機能を解明する重要な手がかりを得ることができた。

自由記述の分野

がんゲノム

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公開日: 2016-06-03  

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