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2016 年度 研究成果報告書

大規模ゲノム配列解析による肺腺がんの亜型分類

研究課題

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研究課題/領域番号 25871068
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 腫瘍診断学
人体病理学
研究機関公益財団法人がん研究会

研究代表者

藤原 大  公益財団法人がん研究会, がん研究所 がんゲノム研究部, 研究員 (00552712)

研究協力者 石川 雄一  公益財団法人がん研究会, がん研究所 病理部, 部長
研究期間 (年度) 2013-04-01 – 2017-03-31
キーワード肺がん / ゲノム解析 / 遺伝子病理診断学
研究成果の概要

肺腺がんのトランスクリプトームデータを公共データベースより取得し、既報の遺伝子セットでサブタイプ分類を実施した。 特にがんゲノムアトラスより548症例の肺腺がんのデータを取得し、トランスクリプトームでのサブタイプ分類を実施後、サ ブタイプごとのゲノム異常を解析した。既報と類似した発現パターンのサブタイプが同定され、特徴的な変異をもつ遺伝子が 得られた。また、サブタイプと関連するマイクロRNA予測を実施した。自施設の肺腺がん24症例のマイクロアレイ実験を行 い、マイクロRNAの網羅的発現解析の結果、サブタイプ特異的なマイクロRNAを同定・検証した。

自由記述の分野

ゲノムインフォマティクス

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公開日: 2018-03-22  

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