哺乳類29種の内在性ウイルス配列の比較ゲノム進化解析

2014 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 25891023
• 研究種目: 研究活動スタート支援
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: 中川 草 東海大学, 医学部, 助教 (70510014)
• 研究期間 (年度): 2013-08-30 – 2015-03-31
• キーワード: 比較ゲノム / 内在性レトロウイルス / レトロトランスポゾン / ジャンクDNA / 分子進化 / バイオインフォマティクス / ゲノム進化 / データベース

研究成果の概要

哺乳類19種の20ゲノム配列を対象に、網羅的に内在性ウイルス（endogenous viral element, EVE）を探索した。その結果736,765配列のERV/EVEを発見し、それぞれについてゲノムでのローカス、塩基・アミノ酸配列、機能モチーフ、最も近い内在性・外来性ウイルス配列などを同定した。それらの情報をまとめてデータベースとして公開した（gEVE, http://geve.med.u-tokai.ac.jp）。

自由記述の分野

生物学