| 研究実績の概要 |
肝細胞癌発癌において腸内細菌叢の関与が報告され、発癌予防の標的として注目されている。本研究では、肝細胞癌患者の腸内細菌叢の特徴を検討することを目的とした。
Ｃ型慢性肝炎由来肝細胞癌患者(HCC)8名、非担癌Ｃ型慢性肝炎患者(CLD)8名、健常者(HD)６名の便中DNAをイルミナ社Miseqを用いて全ゲノムショットガンシーケンシングを行った。QCやヒトゲノムの除去を経て得られたリードから、細菌叢の組成を同定し、クラスタリング、多様性の計算を行なった。肝細胞癌に特徴的な腸内細菌を線形判別分析にて決定した。Average linkage clusteringではHD ５人とCLD ３人が近くクラスタリングされ、HCC8人を含む残りが近くクラスタリングされた。細菌種に対する多様性の指標であるShannon-Wiener Indexの計算ではHD 2.18, CLD 2.12, HCC 2.07と有意差を認めなかった。線形判別分析ではHD群との比較でもCLD群との比較でも、複数の細菌目、科がHCC群に有意に特徴的であった(P＜0.05)。
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