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2015 年度 実績報告書

ナノニードルを用いた核輸送による高効率ゲノム編集

研究課題

研究課題/領域番号 26249127
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

中村 史  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 研究グループ長 (40357661)

研究分担者 加藤 義雄  国立研究開発法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 主任研究員 (20415657)
小林 健  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 集積マイクロシステム研究センター, 研究チーム長 (20415681)
池袋 一典  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70251494)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワードゲノム編集 / ナノニードル / アプタマー / オフターゲット効果 / 細胞操作 / 制御放出
研究実績の概要

本研究では、人工ヌクレアーゼを用いて目的遺伝子以外の部分に損傷を与えない安全で確実、高効率なゲノム編集技術を開発することを目的としている。平成27年度、ZFタンパク質の導入においてATPアプタマーを利用した制御放出を検討し、細胞内にZFタンパク質の導入が可能であることを確認した。これと並行して、FokIアプタマーの探索およびCas9アプタマーの探索を行い、また、ナノニードルアレイを高周波振動することで、細胞内で特異的にgRNAとCas9タンパク質の複合体を放出させる方法を検討し、32%の効率でGFP遺伝子破壊が可能であることを確認した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

加振による物質放出法により、CRISPR/Casシステムの導入を行い、32%のゲノム編集(GFP遺伝子破壊)効率を達成した。細胞にナノニードルアレイを挿入した後に、高周波振動を行うことで、細胞内で特異的な人工ヌクレアーゼの制御放出を行うことに成功したと言える。また、ATPアプタマーを用いた制御放出において、細胞内でZFタンパク質の放出量が増大することを確認した。今後は、ZFヌクレアーゼを導入し、ゲノム編集が可能であるかどうかを検証する。
人工ヌクレアーゼの作製において、GFP融合Cas9タンパク質を新規に作製した。これを用いることによってナノニードル表面上から放出されるgRNA-Cas9複合体の定量的な解析が可能となった。
また、人工ヌクレアーゼを結合するアプタマーとして、FokIアプタマーで7種、Cas9アプタマーで2種の配列の取得に成功している。ATPアプタマーと放出性能を比較しながら、これらアプタマーの利用も併せて検討する。

今後の研究の推進方策

平成28年度は、非相同末端結合による遺伝子修復を回避するために2種のgRNAを同時に導入する手法を開発し、オフターゲット効果と、遺伝子破壊効率の関係を調査する。また、アプタマーを用いた制御放出系によって、ZFNタンパク質を導入することで、ヒトリンパ球細胞等のヒト由来細胞に対してCCR5遺伝子の破壊を試み、オフターゲット効果の発生を評価する。

  • 研究成果

    (25件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (19件) (うち国際学会 6件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Oscillating high-aspect-ratio monolithic silicon nanoneedle array enables efficient delivery of functional bio-macromolecules into living cells2015

    • 著者名/発表者名
      D. Matsumoto, R. Sathuluri, Y. Kato, Y. R. Silberberg, R. Kawamura, F. Iwata, T. Kobayashi and C. Nakamura
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 5 ページ: 15325

    • DOI

      10.1038/srep15325

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] DNA detection technology using zinc finger protein2015

    • 著者名/発表者名
      T. Kumagai, K. Abe, W. Yoshida and K. Ikebukuro
    • 雑誌名

      J. Microb. Biochem. Technol

      巻: 7 ページ: 278-281

    • DOI

      doi:10.4172/1948-5948.1000225

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Enzyme linking to DNA aptamers via a zinc finger as a bridge2015

    • 著者名/発表者名
      K. Abe, Y. Murakami, A.Tatsumi, K. Sumida, A. Kezuka, T. Fukaya, T. Kumagai, Y. Osawa, K. Sode and K. Ikebukuro
    • 雑誌名

      Chem Commun (Camb)

      巻: 51 ページ: 11467-11469

    • DOI

      doi: 10.1039/C5CC02906F

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Non-coding RNAs as molecular tools2015

    • 著者名/発表者名
      R. Wadhwa, Y. Kato, R.Gao and S. C. Kaul
    • 雑誌名

      Post-genomic Approached in Cancer and Nano Medicine

      巻: 2 ページ: 25-60

    • 査読あり
  • [学会発表] Selection and characterization of DNA aptamers against FokI nuclease domain for genome editing2016

    • 著者名/発表者名
      西尾 真初、阿部 公一、松本 大亮、加藤 義雄、中村 史、池袋 一典
    • 学会等名
      Biosensors 2016(26th Anniversary World Congress on Biosensors)
    • 発表場所
      Swedish Exhibition and Congress Centre, Gothenburg, Sweden
    • 年月日
      2016-05-27
    • 国際学会
  • [学会発表] FokIヌクレアーゼドメインに対するアプタマーの探索2016

    • 著者名/発表者名
      西尾 真初、阿部 公一、松本 大亮、加藤 義雄、中村 史、池袋 一典
    • 学会等名
      電気化学会第83回大会
    • 発表場所
      大阪大学工学部(吹田市)
    • 年月日
      2016-03-29
  • [学会発表] 高転移性マウス乳癌細胞株の弾性率の評価2016

    • 著者名/発表者名
      高野 勇太、今泉 美玖、山岸 彩奈、岡田 知子、加藤 義雄、中村 史
    • 学会等名
      電気化学会第83回大会
    • 発表場所
      大阪大学工学部(吹田市)
    • 年月日
      2016-03-29
  • [学会発表] 細胞膜修飾剤BAMの細胞接着力に対する培地温度の影響2016

    • 著者名/発表者名
      松本 雄太、清水 桂太、中村 史
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会(2016)
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス(京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
  • [学会発表] 胞膜流動性を抑制した条件におけるナノニードル貫通効率の解析2016

    • 著者名/発表者名
      清水 桂太、川村 隆三、飯嶋 益巳、黒田 俊一、深沢 今日子、石原 一彦、中村 史
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会(2016)
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス(京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
  • [学会発表] 細胞接着を制御するバイオインターフェース2016

    • 著者名/発表者名
      中村 史
    • 学会等名
      最新バイオインターフェース研究会
    • 発表場所
      やまと会議室(奈良市)
    • 年月日
      2016-02-06
  • [学会発表] 核酸塩基を含むタンパク質の合成2016

    • 著者名/発表者名
      加藤 義雄、小島 直
    • 学会等名
      第15回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所つくばセンター共用講堂(つくば市)
    • 年月日
      2016-02-02
  • [学会発表] Oscillation-assisted controlled release of biomolecules for high-efficient delivery to living cells using silicon nanoneedle array2015

    • 著者名/発表者名
      松本 大亮、加藤 義雄、川村 隆三、小林 健、岩田 太、中村 史
    • 学会等名
      Pacifichem2015
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-18
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of vimentin using antibody-modified nanoneedle and AFM to eliminate undifferentiated iPS cell2015

    • 著者名/発表者名
      清水 桂太、川村 隆三、小林 健、飯嶋 益巳、黒田 俊一、岩田 太、深沢 今日子、石原 一彦、中村 史
    • 学会等名
      Pacifichem2015
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-18
    • 国際学会
  • [学会発表] Nanoneedle technology for single cell biosensing and cell sorting2015

    • 著者名/発表者名
      中村 史
    • 学会等名
      Pacifichem2015
    • 発表場所
      Sheraton Waikiki, Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-18
    • 国際学会
  • [学会発表] ゲノム編集技術への応用を目指したFokIヌクレアーゼドメインに結合するDNAアプタマーの探索及び特性評価2015

    • 著者名/発表者名
      西尾 真初、阿部 公一、松本 大亮、加藤 義雄、中村 史、池袋 一典
    • 学会等名
      BMB2015(第38回 日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
  • [学会発表] Targeted genome manipulation by protein delivery2015

    • 著者名/発表者名
      加藤 義雄、松本 大亮、中村 史
    • 学会等名
      Conference on Transposition and Genome Engineering 2015
    • 発表場所
      甍国際フォーラム(奈良市)
    • 年月日
      2015-11-19
    • 国際学会
  • [学会発表] ビメンチンを標的とした未分化ヒトiPS細胞の機械的分離2015

    • 著者名/発表者名
      清水 桂太、川村 隆三、小林 健、飯嶋 益巳、黒田 俊一、岩田 太、中村 史
    • 学会等名
      第67回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      城山観光ホテル(鹿児島市)
    • 年月日
      2015-10-28
  • [学会発表] FokIヌクレアーゼドメインに対するDNAアプタマーの構造及び機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      西尾 真初、阿部 公一、松本 大亮、加藤 義雄、中村 史、池袋 一典
    • 学会等名
      第67回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      城山観光ホテル(鹿児島市)
    • 年月日
      2015-10-26
  • [学会発表] ネスチン遺伝子破壊のマウス乳癌細胞の転移性への影響2015

    • 著者名/発表者名
      高野 勇太、三島 麻里、今泉 美玖、松本 大亮、岡田 知子、加藤 義雄、中村 史
    • 学会等名
      第67回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      城山観光ホテル(鹿児島市)
    • 年月日
      2015-10-26
  • [学会発表] Site-specific incorporation of a uracil nucleoamino acid into a protein2015

    • 著者名/発表者名
      加藤 義雄、小島 直
    • 学会等名
      International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2015
    • 発表場所
      あいめっせホール(姫路市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 国際学会
  • [学会発表] 高転移性マウス乳癌細胞におけるネスチンノックアウトの効果2015

    • 著者名/発表者名
      中村 史、高野 勇太、三島 麻里、今泉 美玖、松本 大亮、岡田 知子、加藤 義雄
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学工学部黒髪キャンパス(熊本市)
    • 年月日
      2015-09-12
  • [学会発表] FokIヌクレアーゼドメインに対するDNAアプタマーの探索2015

    • 著者名/発表者名
      西尾 真初、阿部 公一、松本 大亮、加藤 義雄、中村 史、池袋 一典
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学工学部黒髪キャンパス(熊本市)
    • 年月日
      2015-09-11
  • [学会発表] ナノニードルアレイを用いたCas9-sgRNA複合体の細胞内輸送2015

    • 著者名/発表者名
      松本 大亮、加藤 義雄、小林 健、岩田 太、中村 史
    • 学会等名
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      熊本大学工学部黒髪キャンパス(熊本市)
    • 年月日
      2015-09-10
  • [備考] セルサージェリー技術の開発

    • URL

      https://unit.aist.go.jp/bmd/biomed-cme/

  • [産業財産権] アミノ酸修飾核酸とその利用2015

    • 発明者名
      加藤義雄、小島直
    • 権利者名
      加藤義雄、小島直
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2015-116992
    • 出願年月日
      2015-06-09

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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