本研究は、イネの穂構造QTLに関係する遺伝子単離の新手法確立と遺伝子間ネットワーク構築を目的とした。穂構造は収量に直接関係する重要形質であり、近年本形質に関連するQTL(遺伝子)も単離・解析され始めたが、現状、QTL遺伝子解析は多大な労力を要し穂構造構築の包括的理解は困難である。本研究においては、従来の形質ベースによる解析に加えて、穂形成時全遺伝子の発現QTL情報を加え、穂形成の遺伝子ネットワークを構築するとともに、ゲノムワイド関連解析(GWAS)の有効性についても検討した。その結果、GWA解析は短期間に非常に大きい成果を生むことが確認され、これまで見出されなかった新規QTLが複数発見された。
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