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2015 年度 実績報告書

転写共役ヌクレオチド除去修復開始反応のin vitro再構成

研究課題

研究課題/領域番号 26291005
研究機関名古屋大学

研究代表者

荻 朋男  名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (80508317)

研究分担者 真下 知士  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (80397554)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワードDNA修復 / 転写と共役したヌクレオチド除去修復
研究実績の概要

UV照射後のPol II のユビキチン化を詳細に解析するためユビキチン化経路に関わるいくつかの阻害因子で細胞を処理したところ、幾つかの阻害剤によりGG-NERは正常だったがTC-NERが減弱した。またsiRNAによるノックダウンの解析では、ある種のE3リガーゼ複合体がPol IIのユビキチン化に関わることが判明した。
UVSSAはpolIIのユビキチン化に関与していると考えられ、幾つかのドメインの変異体を作成し、解析をおこなっている。Pol IIはUVSSA非存在化では迅速に分解されるが、幾つかの変異体ではC32R変異体と同様にPol IIの分解速度の回復はできなかった。
一方、UVSSAの機能解明の糸口として、UVSSAタンパク質の結晶構造解析に挑んでいる。UVSSAは非常に不溶性であるため精製が困難であったが、これまでに本研究においてUVSSAの精製に必要な幾つかの条件を決定した。現在、結晶化に向けた全長UVSSAの精製を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

UVSSAがPol IIの分解サイクルに重要であるという新たな証拠を同定した。
UVSSAタンパク質は本研究を開始した時点では精製すること自体が困難であったが、現在時点では結晶構造解析に向けて大量精製出来る段階にまで進展している。

今後の研究の推進方策

UVSSA依存的に起こるUV照射後のPol IIのユビキチン化サイトをLC/MS/MSを用いて直接同定する。ユビキチン化Pol IIの量が少ないため修飾部位の同定が難しいが、サンプル調整方法を改良して行う。
また、UVSSAをノックアウトしたHCT116細胞からユビキチン化ペプチドを単離・濃縮して行うSILAC解析(ユビキトーム解析)により、Pol IIのユビキチン化におけるUVSSAの作用機序を明らかにしていく。

次年度使用額が生じた理由

本年度は、結晶構造解析と生化学実験の改良を行ったが、共同研究等を活用し、予定していたより安価に実施できた事から、事前に予定していた研究費を次年度に繰り越し、さらなる条件検討を実施するための消耗品費として使用する事とした。

次年度使用額の使用計画

UVSSAによるRNA polⅡoのユビキチン化反応の調査を引き続き実施するための消耗品費として使用する。また、結晶構造解析に特化した精製条件を使用して、標的蛋白質を大量精製する。結晶構造解析のためのスクリーニングを実施するための、消耗品費用に充当する予定である。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] A ten-year follow up of a child with mild case of xeroderma pigmentosum complementation group D diagnosed by whole genome sequencing.2016

    • 著者名/発表者名
      Ono R, Masaki T, Mayca Pozo F, Nakazawa Y, Swagemakers SM, Nakano E, Sakai W, Takeuchi S, Kanda F, Ogi T, van der Spek PJ, Sugasawa K, Nishigori .
    • 雑誌名

      Photodermatol Photoimmunol Photomed

      巻: 32 ページ: 174-180

    • DOI

      10.1111/phpp.12240.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] XRCC4 deficiency in human subjects causes a marked neurological phenotype but no overt immunodeficiency.2015

    • 著者名/発表者名
      Guo C*, Nakazawa Y*(equal contribution), Woodbine L*, Bjorkman A, Shimada M, Fawcett H, Jia N, Ohyama K, Li TS, Nagayama Y, Mitsutake N, Pan-Hammarstrom Q, Gennery AR, Lehmann AR, Jeggo PA, Ogi T.
    • 雑誌名

      Journal of Allergy and Clinical Immunology

      巻: 136 ページ: 1007-1017

    • DOI

      10.1016/j.jaci.2015.06.007.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] SETDB1, HP1 and SUV39 promote repositioning of 53BP1 to extend resection during homologous recombination in G2 cells.2015

    • 著者名/発表者名
      Alagoz M, Katsuki Y, Ogiwara H, Ogi T, Shibata A, Kakarougkas A, Jeggo P§.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 43 ページ: 7931-7944

    • DOI

      10.1093/nar/gkv722.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Novel compound heterozygous DNA ligase IV mutations in an adolescent with a slowly- progressing radiosensitive-severe combined immunodeficiency.2015

    • 著者名/発表者名
      Tamura S, Higuchi K, Tamaki M, Inoue C, Awazawa R, Mitsuki N, Nakazawa Y, Mishima H, Takahashi K, Kondo O, Imai K, Morio T, Ohara O, Ogi T, Furukawa F, Inoue M, Yoshiura K, Kanazawa N.
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Immunology

      巻: 160 ページ: 255-260

    • DOI

      10.1016/j.clim.2015.07.004.

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 「紫外線から遺伝子を守る」紫外線DNA損傷を修復する分子メカニズムとその破綻により発症する疾患の病態解明2016

    • 著者名/発表者名
      荻 朋男
    • 学会等名
      太陽紫外線防御研究委員会第26回シンポジウム
    • 発表場所
      グランフロント大阪(大阪府大阪市)
    • 年月日
      2016-03-04 – 2016-03-04
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム不安定性を示す難治性遺伝性疾患群の症例収集とゲノム・分子機能解析による病態解明研究2015

    • 著者名/発表者名
      中沢 由華、荻 朋男、唐田 清伸、郭 朝万、岡 泰由、 賈 楠、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02 – 2015-12-02
  • [学会発表] XRCC4 deficiency in human subjects causes a marked neurological phenotype but no overt immunodeficiency2015

    • 著者名/発表者名
      郭 朝万、中沢 由華、嶋田 繭子、賈 楠、唐田 清伸、 岡 泰由、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02 – 2015-12-02
  • [学会発表] 各種コケイン症候群の分子診断2015

    • 著者名/発表者名
      賈 楠、中沢 由華、荻 朋男、唐田 清伸、郭 朝万、岡 泰由、 嶋田 繭子、 宮崎 仁美、 千住 千佳子
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02 – 2015-12-02
  • [学会発表] XRCC4deficiencyinhumansubjectscausesamarkedneurologicalphenotypebut no overt immunodeficiency2015

    • 著者名/発表者名
      郭 朝万、中沢 由華、嶋田 繭子、賈 楠、唐田 清伸、岡 泰由、宮崎 仁美、千住 千佳子、荻 朋男
    • 学会等名
      第23回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 発表場所
      焼津グランドホテル(静岡県焼津市)
    • 年月日
      2015-10-20 – 2015-10-20
  • [学会発表] ゲノム不安定性を示す難治性遺伝性疾患群の症例収集とゲノム・分子機能解析による病態解明研究2015

    • 著者名/発表者名
      中沢 由華、荻 朋男、郭 朝万、唐田 清伸、岡 泰由、賈 楠、嶋田 繭子、宮崎 仁美、千住 千佳子
    • 学会等名
      第23回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 発表場所
      焼津グランドホテル(静岡県焼津市)
    • 年月日
      2015-10-20 – 2015-10-20
  • [学会発表] 転写の異常により発症する疾患の診断法と分子病態2015

    • 著者名/発表者名
      荻 朋男
    • 学会等名
      第67回日本皮膚科学会西部支部学術大会
    • 発表場所
      長崎ブリックホール(長崎県長崎市)
    • 年月日
      2015-10-18 – 2015-10-18
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒトXRCC4遺伝子機能の欠損は神経変性と強い放射線感受性を示すが正常な免疫機能を保持する2015

    • 著者名/発表者名
      荻 朋男
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2015-10-08 – 2015-10-10
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ゲノム不安定性疾患の症例収集と新規DNA修復遺伝子の同定2015

    • 著者名/発表者名
      荻 朋男
    • 学会等名
      遺伝研研究集会
    • 発表場所
      国立遺伝学研究所(静岡県三島市)
    • 年月日
      2015-10-01 – 2015-10-02
    • 招待講演

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公開日: 2017-01-06  

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