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2016 年度 実績報告書

RNAサイレンシングの分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26291010
研究機関東京大学

研究代表者

西増 弘志  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (00467044)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
キーワード結晶構造
研究実績の概要

PIWIタンパク質は動物の生殖組織に発現し、piRNA(PIWI-interacting RNA)とpiRISC(piRNA-induced silencing complex)を形成し、トランスポゾンに由来するRNAを抑制することによりゲノム情報を次世代に正確に伝える役割を担う。本研究では、piRISCの作動機構の解明をめざし、カイコに由来するPIWI(Siwi)の結晶構造解析を推進した。抗Siwi抗体を固定化したセファロース担体を用いてBmN4細胞抽出液からSiwiを回収し、サーモリシン処理を行い、Siwiのコア領域を単離し、カラムクロマトグラフィーにより高純度に精製した。変性ゲル電気泳動の結果、精製したSiwiには約28塩基長の内在性のpiRNAが結合しており、Siwi-piRISCを形成していることが明らかになった。Siwi-piRISCを結晶化し、その結晶構造を2.4Å分解能で決定した。Siwiは4つのドメイン(N,PAZ,MID,PIWI)とそれらをつなぐリンカードメイン(L0,L1,L2)から構成され、2つのローブ(N-PAZローブとMID-PIWIローブ)からなる構造をとっていた。piRNAの5′末端および3′末端は、それぞれMID/PIWIドメインおよびPAZドメインに結合していた。Siwiは1位にU塩基をもつpiRNAに結合することと一致し、5′末端にはUに対応する電子密度が観察された。SiwiとhAgo2の構造比較から、各ドメインの構造は似ている一方、MID-PIWIローブに対するN/PAZドメインの配置が顕著に異なることが明らかになった。これらの構造の違いは、両者の機能的な違いを反映していることが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

Siwi-piRISCの結晶構造を決定し、Cell誌に発表したため。

今後の研究の推進方策

Siwi-piRISCの異なる状態の構造決定を行い、その作動機構を明らかにする。

次年度使用額が生じた理由

次年度のX線回折実験に用いるサンプル調製のため。

次年度使用額の使用計画

培地、実験用試薬の購入。

  • 研究成果

    (5件)

すべて 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [国際共同研究] Broad Institute/NIH(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      Broad Institute/NIH
  • [雑誌論文] Structure of Cpf1 in Complex with Guide RNA and Target DNA2016

    • 著者名/発表者名
      Yamano T, Nishimasu H, Zetsche B, Hirano H, Slaymaker IM, Li Y, Fedorova I, Nakane T, Makarova KS, Koonin EV, Ishitani R, Zhang F, Nureki O
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 165 ページ: 946-962

    • DOI

      10.1016/j.cell.2016.04.003

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of silkworm PIWI-clade Argonaute Siwi bound to piRNA2016

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto N, Nishimasu H, Sakakibara K, Nishida KM, Hirano T, Ishitani R, Siomi H, Siomi MC, Nureki O
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 167 ページ: 484-497

    • DOI

      10.1016/j.cell.2016.09.002

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of the Minimal Cas9 from Campylobacter jejuni Reveals the Molecular Diversity in the CRISPR-Cas9 Systems2016

    • 著者名/発表者名
      Yamada M, Watanabe Y, Gootenberg JS, Hirano H, Ran FA, Nakane T, Ishitani R, Zhang F, Nishimasu H, Nureki O
    • 雑誌名

      Mol Cell

      巻: 65 ページ: 1109-1121

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2017.02.007

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Crystal structure of silkworm PIWI, Siwi, in complex with piRNA2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nishimasu, Naoki Matsumoto, Kazuhiro Sakakibara, Kazumichi Nishida, Ryuichiro Ishitani, Haruhiko Siomi, Mikiko C. Siomi, Osamu Nureki
    • 学会等名
      RNA2016
    • 発表場所
      京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-02-16  

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