| 研究課題/領域番号 |
26292139
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| 研究機関 | 広島大学 |
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研究代表者 |
西堀 正英 広島大学, 生物圏科学研究科, 准教授 (80237718)
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| 研究分担者 |
万年 英之 神戸大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (20263395)
下桐 猛 鹿児島大学, 農学部, 准教授 (40315403)
山本 義雄 広島大学, 生物圏科学研究科, 名誉教授 (10032103) [辞退]
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| キーワード | ニワトリ / ブタ / ゲノム情報 / ドメスティケーション / 遺伝的多様性 / ミトコンドリア / SNP / 分子系統 |
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| 研究実績の概要 |
ニワトリとブタは，それぞれヤケイとイノシシから多様な品種が作出され，それらを基に育種改良された。しかしいつ，どこでドメステケーションされ，どのようにグローバル化が進んだのか，まだ詳細な解析結果は明らかではない。本課題では，ニワトリとブタのそれぞれの近縁野生種，アジア在来集団および改良産業品種を対象に，ミトコンドリアDNAやSNPsなどの遺伝マーカーを用い，グローバルかつ大規模に分子系統学的解析を行った。
本課題では，（1）ニワトリとブタSNPs解析システム（DigiTag2），ミトゲノムを用いたグローバルな分子系統樹の構築を試みた。（2）ミトゲノム，SNPsタイピング結果から，ヤケイとニワトリ，イノシシとブタの遺伝的集団構造解析を実施した。（3）遺伝情報から遺伝子流動を推定し，グローバル化の一端を推定した。
１）イノシシ，ブタでは，その分子系統樹はそれぞれの集団毎に分岐，クレードを形成し，①アジアのイノシシと中国由来のブタ，②欧米のブタ集団に大別された。ニホンイノシシ(JWB)とリュウキュウイノシシ（RWB）は遺伝的に分離された。RWBは①沖縄本島，奄美大島，徳之島，加計呂麻島，②石垣島と西表島の大きく二分し，さらに各島々毎に６つにも分岐した。しかしRWBはラオス・カンボジア・ブータンのイノシシと近縁ではなかった。さらにRWBは他のブタ・イノシシと遺伝的に遠く, 特異的な集団構造をとることが明らかになった。
２）ニワトリとヤケイの600個体以上のミトゲノム分子系統樹を構築し，61ハプロタイプを見出した。これらからアフリカ大陸の在来鶏は北部地中海からと南部や中央アフリカを経由する2つのルートで移動した可能性が示唆された。
３）タイでヤケイのドメスティケーションモデルを発見し，本遺伝マーカーシステムを使い，表現型ヤケイ個体の遺伝子型は，ヤケイ集団と在来鶏ハイブリット集団に分かれた。
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| 現在までの達成度 (段落) |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 今後の研究の推進方策 |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| 次年度使用額の使用計画 |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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