研究課題
胸腺内でのヘルパー/キラー系列機構はTCR信号を細胞運命決定機構に変換する制御機構を理解する為の優れたモデルと言える。本研究課題では、ヘルパー/キラー系列に重要なThpok/ Runx3遺伝子に着目し、３次元的なクロマチン構造変化を介したこれら遺伝子の発現制御機構を明らかにすることを目的とし、研究を行った。これまでにinsertion ChIP(iChiP)法によりThpok遺伝子座はキラー系列特異的に制御領域が近接した位置に配置されるクロマチン構造をとること、Thpok遺伝子座と近接する事なる染色体上に位置する遺伝子座の同定を行った。またiChIP法によりThpok遺伝子に近接する遺伝子座から転写させるRNAの会合も検出し、これらの結果から核内でT細胞分化制御に関与する遺伝子群が近接した位置で転写されるfociが形成されている事が示唆された。またBcl11b転写因子のC末端Znフィンガー構造を介して胸腺細胞分化初期過程にThpok遺伝子のクロマチン構造がT細胞型にprimingされることが重要であり、胸腺細胞初期分化過程でのBcl11bを介したThpok遺伝子の発現抑制は従来のサイレンサー領域非依存性であることを見出した。また生化学的手法によりThpokサイレンサー結合因子遺伝子として同定したSATB1はゲノムオーガナイザーとして知られていたが、遺伝子改変マウスの表現型解析、ChIP-seq等の解析により、SATB1はThpok、Runx3、Foxp3、CD4、CD8遺伝子といったが胸腺細胞の系列決定に重要な遺伝子群の発現制御に必須であることを見出した。またThpok遺伝子とCd4遺伝子座間でサイレンサーを入れ替えたアレルの解析から、制御領域の機能発現には遺伝子座特異的な特性が関与していることを見出した。
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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Scientific Reports
巻: 7 ページ: 41351
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Nature Immunology
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International Immunology
