| 研究課題/領域番号 |
26305011
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| 研究機関 | 高知大学 |
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研究代表者 |
吾妻 健 高知大学, 学内共同利用施設等, 名誉教授 (40117031)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| キーワード | ウエステルマン肺吸虫 / フォスファーゲンキナーゼ遺伝子 / PKD1イントロン3 / スリランカ / インド / タイ / フィリピン / PCR |
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| 研究実績の概要 |
アジアにおけるウエステルマン肺吸虫の２倍体集団間の遺伝的分化、地理的分化の程度、並びに２倍体と３倍体の遺伝的分化、地理的分化の程度の種々のパラメータについて算出するため、核遺伝子であるフォスファーゲンキナーゼ（PK）遺伝子のPwPkD1Int3領域（約770bp）の塩基配列を解析した。全てのサンプルは、個体別に、Pk遺伝子ドメイン１イントロン３PwPkD1Int3（約770bp）をPCR法にて遺伝子増幅を行い、シーケンスを行なった。２倍体の集団（韓国４隻、台湾９隻、日本18隻、中国15隻）の60.87％がホモ接合体、39.13％がヘテロ接合体であった。一方、３倍体の集団（21隻）は、すべてがヘテロ接合体であった。DnaSP（ver 5.10）を用いて、ハプロタイプの種類とその頻度を求めたところ、韓国では、12、台湾では、8、日本では、19、中国では、31のハプロタイプがそれぞれ観察された。また、今回調べた、67隻のPwサンプルの中から、54種類のハプロタイプが検出され、東アジアのPw集団は、PwPkD1Int3遺伝子領域において、極めて多型的であることが、明らかとなった。一方、国別（韓国集団、台湾集団、日本集団、中国集団）集団間の遺伝的距離（φSTなど）の統計的有意検定を行なったところ、各集団間に有意な差が見出され、東アジアに生息するウエステルマン肺吸虫集団が、高度に分化していることが暗示された。今後は、インド、スリランカ、マレーシア、タイ、フィリピンの集団を本年と同様にPwPkD1Int3領域を用いて、解析を行なう。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
東南アジアにおける各国のPwサンプルの採集、PwPkD1Int3領域のシーケンスの解析、集団間の統計遺伝学的分析は、スムーズに行なえている。
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| 今後の研究の推進方策 |
これまでと同様に研究は推進し、特に変更は、考えていない。ただし、タイのサンプルが少ないので、タイの共同研究者とその点について議論する。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
学会への参加ができなかった。
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| 次年度使用額の使用計画 |
薬品等の購入予定
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