• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2016 年度 研究成果報告書

コドン縮約表現に基づくタンパク質-遺伝子モチーフ辞書システムの開発

研究課題

  • PDF
研究課題/領域番号 26330250
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 知能情報学
研究機関豊橋技術科学大学

研究代表者

加藤 博明  豊橋技術科学大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (30303704)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード分子構造情報処理 / 配列モチーフ / タンパク質 / 遺伝子 / コドン縮約表現 / コドン重み行列 / 三次元モチーフ / データベース
研究成果の概要

本研究では、アミノ酸配列モチーフを原点として、その対応する遺伝子配列(コーディング領域)、およびそのタンパク質立体構造までを関連づけたタンパク質-遺伝子モチーフ辞書の構築を試みた。また、アミノ酸配列モチーフに対応するコドン重み行列をもとに、モチーフコドン縮約表現を提案するとともに、ゲノム配列の機能部位推定への応用を試みた。EF-handモチーフを例とした解析実験の結果、TNNC1中のイントロンによって隔てられた2ヶ所の機能部位を正しく検出することができた。

自由記述の分野

分子情報工学・分子生命情報学

URL: 

公開日: 2018-03-22  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi