研究実績の概要 |
最終年度に実施した研究の成果:ネットワークの階層構造を利用して遺伝子ネットワーク同定制度を改善するためには,それぞれの制御候補に対して自信度を割り当てる遺伝子ネットワーク同定法が必要である.我々はこれまで線形LPMとブートストラップ法を用いた方法を利用してきたが,その他の方法でも提案手法の有用性を確認するため,ランダムフォレストを利用し,それぞれの制御候補に自信度を割り当てる方法を開発した.これにより従来よりも高い同定性能を実現した.本研究の成果は国際会議論文(Inference of Genetic Networks Using Random Forests: Use of Different Weights for Time-series and Static Gene Expression Data, Proc. of the 18th IEEE BIBE, 98-103, 2018)にて発表した.また論文誌(Inference of Genetic Networks using Random Forests: Assigning Different Weights for Gene Expression Data, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, in press)に掲載予定である. 研究期間全体を通じた成果:ネットワークの階層構造を利用して遺伝子ネットワーク同定制度を改善するための方法を開発した.その成果は学術誌論文2編,国際会議論文1編などで発表を行った.また本手法は既存の手法と組み合わせて実行する手法である.複数の既存の手法と組み合わせて実行できるかを確認するために,様々な遺伝子ネットワーク同定法の開発を併せて行った.その成果は図書1編,学術誌論文2編,国際会議論文3編などで発表を行った.
|