糖の種類を考慮したタンパク質の糖鎖修飾予測法の開発およびデータベース構築

2016 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 26330332
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生命・健康・医療情報学
• 研究機関: 明治大学
• 研究代表者: 池田 有理 明治大学, 理工学部, 専任准教授 (30371082)
• 研究協力者: 越中谷 賢治 ; 小川 翼 ; 高知尾 尚志 ; 永島 啓矢 ; 濱田 康太 ; 杉田 大夢 ; 髙橋 大輝 ; 山口 拓哉 ; 内海 昴之 ; 亀卦川 樹 ; 北田 洋平
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: バイオインフォマティクス / タンパク質 / アミノ酸配列 / 二次構造 / 立体構造 / 細胞内局在 / 糖鎖修飾 / 予測法

研究成果の概要

本研究では、糖の種類を考慮したタンパク質糖鎖修飾予測法の開発を行った。糖鎖修飾を受けているタンパク質のアミノ酸配列、糖鎖修飾位置周辺の二次構造解析、糖鎖修飾位置周辺の空間的アミノ酸出現傾向解析・細胞内局在性について糖種特異的な特徴を抽出するとともに、糖種判別に利用可能なパラメータを探索し、高精度糖種判別法の開発を行った。アミノ酸配列と細胞内局在性をパラメータに用いることで、高精度で糖種判別が可能となった。

自由記述の分野

生命情報科学