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本研究で取得したイネデータ（イルミナショートリード、PacBioロングリード）を含めた全ゲノムシークエンスリードを用いて、酵母、線虫、イネのゲノムアセンブリを構築し、そのエラー特性等の統計値を計測した。コンティグやリードのアライメント特性についての真・偽アライメント間の尤度比を利用することにより、アセンブリ中のギャップ領域を高精度で修復するツール（GMcloser）を開発した。そのほかにアセンブリ中のミスアセンブリを計測するツール（GMvalue）やアセンブリを伸張・再アセンブルするツール（Exterm）の開発を行った。
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