• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2015 年度 実施状況報告書

褐藻の青色光応答反応の解析

研究課題

研究課題/領域番号 26440156
研究機関立命館大学

研究代表者

高橋 文雄  立命館大学, 生命科学部, 助教 (60332318)

研究分担者 吉川 伸哉  福井県立大学, 海洋生物資源学部, 准教授 (20405070)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード褐藻 / トランスクリプトーム / Aureochrome / 青色光受容体
研究実績の概要

オーレオクロム(Aureochrome)は、転写因子型の青色光受容体であり、褐藻や珪藻、赤潮の原因藻類であるラフィド藻を含む黄色植物のみが持つ。現在、黄緑藻類フシナシミドロと珪藻において、オーレオクロムが形態形成や細胞増殖に効果があると報告されている。しかし、多細胞化し進化的・水産業的に有用な褐藻においては、このオーレオクロムの効果は解析されていない。本研究では、褐藻2種(ヤハズグサ、アカモク)を用い、青色応答反応の解析と光受容体の探索等を主な目的としている。
昨年度まで、2種のトランスクリプトームが終了し、現在アカモクのゲノムを解析中である。トランスクリプトームおいてはオーレオクロムのオーソログを含む青色光受容体が発見された。一方オーレオクロムは転写因子でもあるため、ゲノム解析を行って、遺伝子上流のシス配列の解析を行っている。今後、単離された各種青色光受容体について生化学的解析を行う予定である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究では、トランスクリプトームを主体として、光受容体の単離や発言パターンを重要な課題としていたが、おおむね順調に進んでいる。一方、ゲノム解析が申請時より安価になったため、現在PacBioを用いたゲノム上のシス配列の取得まで解析中である。これらによって、オーレオクロムからの遺伝子カスケードが理解できるようになると考えられる。

今後の研究の推進方策

①最終年度は、アカモクにおける遺伝子発現の変化があった遺伝子の上流のシス配列の探索を行う。
②ヤハズグサのトランスクリプトーム解析が終了したことから、生化学的な解析を行う。
③上記褐藻2種の生理反応について、植物ホルモン等の効果が得られたことから、より詳細に解析する予定である。
以上の三点について論文執筆予定である。

次年度使用額が生じた理由

平成25年度に科学研究補助費取得者対象者の研究支援事業として、新学術領域「ゲノム支援」に採択され、本科研費で使用する予定であったトランスクリプトーム解析を、無償で行えたため、少額であるが研究額の余剰が起こっている。

次年度使用額の使用計画

以上の支援事業の結果から、データの解析(遺伝子発現)が進み、別のデータ解析(ゲノム)を行う必要性があることからそれらの解析に充当する予定である。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Blue-light-regulated transcription factor, Aureochrome, in photosynthetic stramenopiles2016

    • 著者名/発表者名
      Takahashi F
    • 雑誌名

      J Plant Res

      巻: 129 ページ: 189-197

    • DOI

      10.1007/s10265-016-0784-5

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] RNA sequencing revealed numerous polyketide synthase genes in the harmful dinoflagellate Karenia mikimotoi2015

    • 著者名/発表者名
      Kimura K, Okuda S, Nakayama K, Shikata T, Takahashi F, Yamaguchi H, Sakamoto S, Yamaguchi M, Tomaru Y
    • 雑誌名

      PLOS One

      巻: 10 ページ: 0142731

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0142731

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Delineating a new heterothallic species of Volvox (volvocaceae, chlorophyceae) using new strains of “Volvox africanus”2015

    • 著者名/発表者名
      Nozaki H, Matsuzaki R, Yamamoto K, Kawachi M, Takahashi F
    • 雑誌名

      PLOS One

      巻: 10 ページ: 0142632

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0142632

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] RNA-seqによる褐藻アカモクの青色光受容体の解析2016

    • 著者名/発表者名
      吉川伸哉、細川真美、上井進也、奥田修二郎、笠原賢洋、高橋文雄
    • 学会等名
      日本藻類学会第40回大会
    • 発表場所
      日本歯科大学(東京都千代田区)
    • 年月日
      2016-03-19
  • [学会発表] 藻類の青色光受容体とそれらの機能2016

    • 著者名/発表者名
      高橋文雄
    • 学会等名
      日本プランクトン学会シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-03-14
  • [学会発表] 黄金藻オクロモナスAureochromeの光依存的なDNA結合能の解析2015

    • 著者名/発表者名
      位田康熙、池田美恵、笠原賢洋、高橋文雄
    • 学会等名
      日本植物学会第79回大会
    • 発表場所
      新潟大学(新潟県新潟市)
    • 年月日
      2015-09-07
  • [学会発表] 黄金色藻が持つオーレオクロムの光受容能およびDNA結合能の解析2015

    • 著者名/発表者名
      位田康熙、池田美恵、笠原賢洋、高橋文雄
    • 学会等名
      日本生化学会近畿支部例会
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀県草津市)
    • 年月日
      2015-05-16
  • [図書] 光と生命の事典 オーレオクロム 章分担2016

    • 著者名/発表者名
      高橋文雄
    • 総ページ数
      436
    • 出版者
      朝倉書店

URL: 

公開日: 2017-01-06  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi