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2015 年度 実施状況報告書

大規模比較ゲノム解析からカシ林の生物間ネットワークの成立・変遷の歴史を復元する

研究課題

研究課題/領域番号 26440214
研究機関京都大学

研究代表者

青木 京子  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 研究員 (70378537)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード分子植物地理学
研究実績の概要

本研究の目的は,照葉樹林の中で比較的耐寒性のあるカシ類の歴史的変遷を追跡することである。植物で使えるDNA多型情報は分子進化速度が遅いため種内変異量が少なく,分布変動を追跡するマーカーとして十分ではなかった。本研究では,近年の遺伝子解析技術の発展によって低コストで使えるようになった次世代シーケンサーも活用し,これまで行われてきた少数遺伝子座を対象にしたDNA多型解析からは推定できなかったような過去数千年単位の分布変遷や集団動態の変遷を読み取る。また,カシ林の優占樹種とそれに密接にかかわって生活している昆虫などについても遺伝解析を行い,遺伝的変異の地理的パターンや遺伝的多様性を種群間で比較・統合し,カシ林の生態系ネットワークの成立過程を解明する。今年度は,カシ類に潜葉する植食性昆虫ツヤコガ類のミトコンドリアDNAを解析し,シイ類に潜葉するツヤコガ類との遺伝的関係を明らかにし,カシ類に潜葉する植食性昆虫ツヤコガ類の種内の遺伝的変異を解析した。カシ林に生活し, カシ類と種間関係をもつ生物種群において遺伝構造や遺伝的多様性を比較することによって生態系全体の歴史的成立過程を解明できる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

葉および植食性昆虫類のサンプル採集・整理状況は概ね順調であり,遺伝子解析も順調に進んでいる。

今後の研究の推進方策

収集したサンプリングの解析を進める。次世代シークエンサーによる遺伝子解析によって,カシ類の系統解析および種内多型の地理的分布パターンを調べる。

次年度使用額が生じた理由

解析内容変更のため

次年度使用額の使用計画

次世代シーケンサーによる解析費用に用いる。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うちオープンアクセス 1件) 学会発表 (1件) 図書 (5件)

  • [雑誌論文] 【解 説】シリーズ「日本の森林樹木の地理的遺伝構造(11) シイ類(ブナ科シイ属)2015

    • 著者名/発表者名
      青木京子
    • 雑誌名

      森林遺伝育種

      巻: 4 ページ: 173-179

    • オープンアクセス
  • [学会発表] RADseq法を用いた日本のカシ類の系統解析2016

    • 著者名/発表者名
      青木京子・瀬尾明弘・手塚あゆみ・永野惇・井鷺裕司
    • 学会等名
      日本植物分類学会第15回大会
    • 発表場所
      富山大学
    • 年月日
      2016-03-06 – 2016-03-08
  • [図書] ホルトノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」2015

    • 著者名/発表者名
      青木京子・村上哲明(津村義彦・陶山佳久(編))
    • 総ページ数
      pp. 96-97
    • 出版者
      文一総合出版
  • [図書] バクチノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」2015

    • 著者名/発表者名
      青木京子・村上哲明(津村義彦・陶山佳久(編))
    • 総ページ数
      pp. 98-99
    • 出版者
      文一総合出版
  • [図書] カナメモチ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」2015

    • 著者名/発表者名
      青木京子・村上哲明(津村義彦・陶山佳久(編))
    • 総ページ数
      pp. 108-109
    • 出版者
      文一総合出版
  • [図書] コショウノキ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」2015

    • 著者名/発表者名
      青木京子・村上哲明(津村義彦・陶山佳久(編))
    • 総ページ数
      pp. 147-148
    • 出版者
      文一総合出版
  • [図書] スダジイ「地図でわかる樹木の種苗移動ガイドライン」2015

    • 著者名/発表者名
      上野真義・青木京子 (津村義彦・陶山佳久(編))
    • 総ページ数
      pp. 114-116
    • 出版者
      文一総合出版

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公開日: 2017-01-06  

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