マダイ養殖は沿岸域に海面網生け簀を設置して行われているため、自然災害による生け簀網の損壊や生け簀内での産卵等により、養殖マダイが自然界に加入していることが、懸念される。本研究では、マダイ養殖が天然集団に及ぼす遺伝的影響を機能性DNAマーカーおよび中立性DNAマーカーにより養殖由来の個体の混入率を推定し、明らかにすることを目的とした。機能性DNAマーカーでは、天然集団におけるマダイ養殖の遺伝的影響について調べる研究には適さなかったが、中立性DNAマーカーでは、養殖が盛んな宇和島海域において多くの養殖マダイの存在が明らかになり、遺伝的攪乱の可能性が示された。
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