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2014 年度 実施状況報告書

パーソナルゲノムを用いたメタボリック症候群・動脈硬化の個別化予防に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 26460741
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

村松 正明  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (50230008)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワードパーソナルゲノム / 予防医学 / 生活習慣病 / 多因子疾患 / 糖尿病 / 動脈硬化 / リスク予測
研究実績の概要

本年度は2 型糖尿病リスク判定システムの作成および評価を主として行った。日本人2型糖尿病関連解析の論文279報から、GWASで関連が明らかにされた一塩基多型129個を抽出しキュレーションを行った。その結果29SNPsについて既存の論文・データベースから尤度比を算出した。これらの遺伝子情報および国民健康・栄養調査等のデータベース・論文から抽出した、年齢・性・BMIおよび血圧値のリスク因子を取り入れたリスク判定システムを作成した。地域住民コホート(n=1263)のデータを元にリスク判定システムの評価を行ったところ、C統計解析においてAUC=0.707の値が得られ、従来のリスク判定法であるTOPICSとほぼ同レベルのリスク判定が出来る可能性が示唆された。今後は更に多くの遺伝因子や環境因子を加えて判定精度を上げて行く必要があると考えられた。
また動脈硬化性疾患の遺伝子解析に関してはイルミナ社DNAChipにおけるSNP解析を継続しており、冠動脈硬化指数、脳動脈硬化指数、全身性動脈硬化指数のパラメータに加えて、腹部大動脈瘤等の幅広い表現形質との関連についての検討を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

2 型糖尿病リスク判定システムの作成および評価に関しては論文発表を行い、順調に進んでいる。動脈硬化性疾患の遺伝子解析に関しては、現在解析を継続中であり、解析対象を冠動脈硬化指数、脳動脈硬化指数、全身性動脈硬化指数に加えて、腹部大動脈瘤等の幅広い表現形質に付いても解析を進めることとした。また健康・疾病状況に関する自己管理指標の作および)心理的因子および行動変容に関する調査票の作成および評価方法の検討に関してはアンケートの質問項目が決定したので概ね順調である。

今後の研究の推進方策

2 型糖尿病リスク判定システムの作成および評価に関しては、更にリスク評価精度を向上させるための、解析項目(レアバリアント、エピゲノム)あるいはオミックス解析による臨床情報を追加する必要があり、これらの検討を継続する。動脈硬化性疾患の遺伝子解析に関しては解析対象を冠動脈硬化指数、脳動脈硬化指数、全身性動脈硬化指数に加えて、腹部大動脈瘤等の幅広い表現形質に付いても解析を進める。また遺伝子検査による疾患リスク評価システム(作成済)を用いて臨床医が疾患リスクを説明する ことにより 遺伝子検査前後において健康観・疾病観において変化があるかどうかアンケートを実施・解析をして行く。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Likelihood ratio-based integrated personal risk assessment of type 2 diabetes2014

    • 著者名/発表者名
      Sato N, Htun NC, Daimon M, Tamiya G, Kato K, Kubota I, Ueno Y, Yamashita H, Fukao A, Kayama T, Muramatsu M
    • 雑誌名

      Endocrine Journal

      巻: 61 ページ: 967-988

    • DOI

      25069673

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 尤度比を用いた2型糖尿病の統合的リスク評価2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤憲子
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第59回大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-11-20
  • [学会発表] The effect of genetic test for common diseases on the perception of health and illness2014

    • 著者名/発表者名
      村松正明
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-10-02

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公開日: 2016-05-27  

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