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2016 年度 実施状況報告書

H. pylori除菌後胃癌の網羅的遺伝子解析による胃癌危険因子の特定

研究課題

研究課題/領域番号 26460942
研究機関大分大学

研究代表者

兒玉 雅明  大分大学, 福祉健康科学部, 教授 (20332893)

研究分担者 村上 和成  大分大学, 医学部, 教授 (00239485)
沖本 忠義  大分大学, 医学部, 講師 (90381037)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
キーワードH. pylori / gastric cancer / 次世代シーケンサー解析 / TP53 / PDGRA
研究実績の概要

【目的】次世代シーケンサー解析を用いた網羅的遺伝子解析によりH. pylori除菌後胃癌発症に関わる癌遺伝子の特定と除菌後胃癌危険因子の解析を行った。
【方法】集積した除菌後胃癌は71例81病変となった。平成27年度まで高分化型の除菌後胃癌、H. pylori陽性胃癌各5例によりDNAを抽出。次世代シーケンサーによる網羅的遺伝子解析を行った。平成28年度には低分化型胃癌の次世代シーケンサー解析を行った。
【結果】次世代シーケンス解析では、50遺伝子中21遺伝子に変異を認めた。
APC,ATM, CSF2R, ERBB4, FGFR3, FLT3, KDR, PDGFRA, RET, STK11, TP53において80%以上の症例に変異を認めた。PDGFRA chr4 exon18のhotspot変異はH. pylori陽性群全例にみられたが、除菌後胃癌は1例も認めず、また解析遺伝子中Hotspot変異はH. pylori陽性胃癌において多い傾向がみられ両群間の発癌におけるgeneticな相違が考慮された。
集積した除菌後胃癌症例中、進行癌症例、また低分化型胃癌症例も少なからず認められ、これらの解析を行う必要が考慮された。除菌後癌の深達度でSM以深は17例認められた。深達度M群およびSM以深群の比較では、除菌後経過観察の有無、腫瘍径、発生部位、形態、組織型に有意差を認め、除菌後における進行胃癌は早期胃癌と異なる発生の機序を有す可能性が示唆された。除菌後胃癌およびH. pylori陽性胃癌の進行低分化型胃癌の各5症例からDNAを抽出し、次世代シーケンサー解析を進めている。シーケンスデータを平成29年度前半に得る予定であり、この結果は除菌後胃癌高分化型、低分化型の発生機序の相違を明らかにし、除菌後胃癌高リスク因子の抽出、除菌後胃癌早期発見、予防に寄与すると考えられる。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

集積できた除菌後胃癌は71例81病変となり、当初目標よりも多く、また更に集積が可能である。
はじめの高分化型胃癌のDNA抽出から次世代シーケンサー解析は、順調に新調した。次世代シーケンス解析では、50遺伝子中21遺伝子に変異を認め、特にPDGFRA chr4 exon18のhotspot変異はH. pylori陽性群全例にみられたが、除菌後胃癌は1例も認めず、また解析遺伝子中Hotspot変異はH. pylori陽性胃癌において多い傾向がみられ両群間の発癌におけるgeneticな相違が考慮された。このように除菌後胃癌特有の遺伝子異常が確認されている。しかし、除菌後胃癌において深達度SM以深に進行したものが17例も認められた。低分化型腺癌はこのうち11例認められ、漿膜側へ露出が見られた症例も存在した。腫瘍死を起こさないことが一番の目標で有り、これら低分化型胃癌の解析を28年度に行った。
臨床病理学的特性の解析は、順調に進み、除菌後進行癌では、除菌後経過観察の有無、腫瘍径、発生部位、形態、組織型に有意差を認めた。また免疫組織化学結果では、胃型形質の増加が認められ、腸型形質の抑制が考慮された。
しかし、次世代シーケンサー解析の対象とする低分化型除菌後胃癌の集積がかなり時間を要し、これが進捗状況の遅れの一因となった。
また、症例集積後、DNAを抽出し、解析に取りかかったが、パラフィン包埋ブロックから抽出したDNAの断片化が思ったよりも進行した症例が見られた。DNA抽出から再度やり直し、品質評価を繰り返したため、これも研究進捗の遅れとなっている。
現在は、いずれも次世代シーケンサー解析可能なDNA収量が確保され、現在解析を行っている。

今後の研究の推進方策

除菌後胃癌およびH. pylori陽性胃癌における進行、低分化型胃癌各症例の10%中性緩衝ホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE)ブロックより10 μmの厚さで3-6枚薄切し、 QIAamp DNA FFPE Tissue Kit56404 (キアゲン)を用い同検体よりDNAの抽出を行った。
DNA濃度は291.3から661.2 mg/mlであり、断片化がややみられるものの、コントロールとして行ったβactinをプライマーとしたPCRでは、十分に増幅可能であった。
次世代シーケンスは、タカラバイオ株式会社、バイオメディカルセンターに委託、提供した資料を用い、品質検定を行い、シーケンスライブラリーを作製、
Ion Protonシーケンサー (ライフテクノロジーズ社)による高速シーケンス解析を開始している。シーケンスデータを平成29年度前半に得る予定である。
この結果、除菌後胃癌における早期、高分化型から進行、低分化型までの胃癌の網羅的遺伝子解析を行うことができ、高分化と低分化の比較、またH. pylori陽性胃癌との比較が可能である。これらからH. pylori除菌後胃癌における重要な遺伝子特異点の発見、除菌後胃癌発症のメカニズム解明をめざす。また臨床的、組織学的に除菌後胃癌の高危険群を抽出することで、全症例除菌時代に向け、除菌後胃癌の更なる抑制、また危険度に応じたスクリーニングを行うことで、的確な早期胃癌の発見、患者の負担軽減、医療経済への寄与が可能になると考える。

次年度使用額が生じた理由

除菌後胃癌中、低分化型胃癌の解析を28年度に行った。除菌後進行癌では、除菌後経過観察の有無、腫瘍径、発生部位、形態、組織型に有意差を認めた。また免疫組織化学結果では、胃型形質の増加が認められ、腸型形質の抑制が考慮された。
しかし、次世代シーケンサー解析の対象とする低分化型除菌後胃癌の集積がかなり時間を要した。またパラフィン包埋ブロックから抽出したDNAの断片化が思ったよりも進行した症例があり、DNA抽出から再度やり直し、品質評価を行ったため、これらが研進捗状況の遅れの一因となった。そのため、次世代シーケンサー解析に用いる予定の費用が今年度未使用となった。

次年度使用額の使用計画

現在、除菌後胃癌中、低分化型で進行癌症例5例と、H. pylori陽性低分化型胃癌5例からDNAを抽出し、次世代シーケンサー解析を開始している。平成29年度前半には、癌遺伝子50遺伝子の解析が完了予定、その後評価を行い、除菌後胃癌における低分化型、高分化型胃癌の特性解析を完了する予定である。
平成28年度に未使用であった次世代シーケンサー解析に用いる予定の費用は、解析終了する平成29年度前半に全額使用予定である。

  • 研究成果

    (33件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 7件)

  • [雑誌論文] Differences in amino acid frequency in CagA and VacA sequences of Helicobacter pylori distinguish gastric cancer from gastric MALT lymphoma.2016

    • 著者名/発表者名
      1.Hashinaga M, Suzuki R, Akada J, Matsumoto T, Kido Y, Okimoto T, Kodama M, Murakami K, Yamaoka Y.
    • 雑誌名

      Gut Pathog

      巻: 8 ページ: 54

    • DOI

      10.1186/s13099-016-0137-x

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Reduced phosphorylation of ribosomal protein S6 is associated with sensitivity to MEK inhibition in gastric cancer cells.2016

    • 著者名/発表者名
      2.Hirashita Y, Tsukamoto Y, Yanagihara K, Fumoto S, Hijiya N, Nakada C, Uchida T, Matsuura K, Kodama M, Okimoto T, Daa T, Seike M, Iha H, Shirao K, Murakami K, Moriyama M.
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 107 ページ: 1919-1928

    • DOI

      10.1111/cas.13094

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Esomeprazole- or rabeprazole-based triple therapy eradicated Helicobacter pylori comparably regardless of clarithromycin susceptibility and CYP2C19 genotypes.2016

    • 著者名/発表者名
      3.Okimoto T, Mizukami K, Ogawa R, Okamoto K, Shuto M, Fukuda K, Kodama M, Murakami K.
    • 雑誌名

      J Clin Biochem Nutr.

      巻: 59 ページ: 149-153

    • DOI

      10.3164/jcbn.16-18

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] わが国における薬剤耐性Helicobacter pyloriの現状―2013~2014年度耐性菌サーベイランスの集計報告―2016

    • 著者名/発表者名
      橋永正彦、沖本忠義、兒玉雅明、水上一弘、小川竜、岡本和久、首藤充孝、福田健介、園田光、福田昌英、本田俊一郎、山岡吉生、村上和成
    • 雑誌名

      日本ヘリコバクター学会誌

      巻: 17 ページ: 45-49

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 胃炎の京都分類の代表的所見 除菌後の胃粘膜変化2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、小川竜、岡本和久、水上一弘、小野雅美、佐藤竜吾、村上和成
    • 雑誌名

      Helicobacter Research

      巻: 20 ページ: 346-348

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ラテックス凝集免疫比濁法を用いた新規Helicobacter pylori抗体検出キットの有用性の検討2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、小川竜、岡本和久、水上一弘、村上和成
    • 雑誌名

      医学と薬学

      巻: 73 ページ: 737-744

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 陥凹を呈する病変 上皮性・非腫瘍性 胃限局性びらん2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、村上和成
    • 雑誌名

      消化器内視鏡

      巻: 20 ページ: 1286-1287

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Helicobacter pylori除菌により萎縮, 腸上皮化生は改善しますか?2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、阿部寿徳、小川竜、岡本和久、水上一弘、松成修、相馬渉、安部高志、永井敬之、有田毅、村上和成
    • 雑誌名

      Helicobacter Research

      巻: 20 ページ: 531-535

    • 査読あり
  • [学会発表] Reappearance and drug resistant rates of Helicobacter pylori after successful eradication therapy in Japan2017

    • 著者名/発表者名
      Okimoto T, Mizukami K, Ogawa R, Okamoto K, Shuto M, Fukuda K, Kodama M, Murakami K
    • 学会等名
      World Congress of Gastrointestinal Endoscopy ENDO 2017
    • 発表場所
      Hyderabad International Convention Center, Hyderabad, India
    • 年月日
      2017-02-16 – 2017-02-19
    • 国際学会
  • [学会発表] 17 cases of helicobacter pylori infection negative gastric cancer2017

    • 著者名/発表者名
      Okamoto K, Kodama M, Okimoto T, Ogawa R, Fukuda K, Matsunari O, Mistutaka S, Mizukami K, Murakami K
    • 学会等名
      World Congress of Gastrointestinal Endoscopy ENDO 2017
    • 発表場所
      Hyderabad International Convention Center, Hyderabad, India
    • 年月日
      2017-02-16 – 2017-02-19
    • 国際学会
  • [学会発表] 血清抗 Helicobacter pylori 抗体 ≧ 3.0 U/mlを対象とした胃がんリスク検診2016

    • 著者名/発表者名
      首藤充孝、松成修、山岡吉生、藤岡利生、村上和成、兒玉雅明、沖本忠義、瀧上茂、野中良仁、下瀬裕子、伊南冨士子、藤田健治、佐藤竜吾、岡本和久、水上一弘
    • 学会等名
      第108回日本消化器病学会九州支部例会・第102 回日本消化器内視鏡学会九州支部例会
    • 発表場所
      ホテル日航熊本,熊本市、熊本県
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-26
  • [学会発表] 除菌後発見された胃底腺型胃癌の 3 例2016

    • 著者名/発表者名
      児玉紘祐、岡本和久、首藤充孝、福田健介、安部雄治、廣島康子、小川竜、松成修、水上一弘、沖本忠義、兒玉雅明、村上和成
    • 学会等名
      第108回日本消化器病学会九州支部例会・第102 回日本消化器内視鏡学会九州支部例会
    • 発表場所
      ホテル日航熊本,熊本市、熊本県
    • 年月日
      2016-11-25 – 2016-11-26
  • [学会発表] Helicobacter pylori感染と胃癌2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、村上和成
    • 学会等名
      第92回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      神戸国際会議場、(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2016-11-05 – 2016-11-05
  • [学会発表] 食道扁平上皮癌CRT後遺残・再発病変に対するESDの有用性2016

    • 著者名/発表者名
      小川竜、岡本和久、園田光、首藤充孝、橋永正彦、福田健介、水上一弘、沖本忠義、兒玉雅明、村上和成
    • 学会等名
      第92回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      神戸国際会議場、(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2016-11-03 – 2016-11-05
  • [学会発表] Relationship between endoscopic atrophic classification and histological atrophy and intestinal metaplasia before and after H. pylori eradication.2016

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Kodama, Tadayoshi Okimoto, Hisanori Abe, Ryo Ogawa, Kazuhisa Okamoto, Kazuhiro Mizukami, Wataru Soma, Takashi Abe, Takayuki Nagai, Tsuyoshi Arita, Kazunari Murakami.
    • 学会等名
      APDW 2016; Asian Pacific Digestive Week
    • 発表場所
      Kobe Convention Center, Kobe, Japan.
    • 年月日
      2016-11-03 – 2016-11-03
    • 国際学会
  • [学会発表] Drug resistant and recurrence rate of Helicobacter pylori after successful eradication therapy in Japan2016

    • 著者名/発表者名
      Tadayoshi Okimoto, Kazuhiro Mizukami, Ryo Ogawa, Kazuhisa Okamoto, Mitsutaka Shuto, Kensuke Fukuda, Masaaki Kodama, Kazunari Murakami
    • 学会等名
      APDW 2016; Asian Pacific Digestive Week
    • 発表場所
      Kobe Convention Center, Kobe, Japan.
    • 年月日
      2016-11-02 – 2016-11-05
    • 国際学会
  • [学会発表] Availability of endoscopic image using Linked Color Imaging regarding to gastric mucosal atrophic borders2016

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Mizukami, Tadayoshi Okimoto, Masaaki Kodama, Kazunari Murakami
    • 学会等名
      APDW 2016; Asian Pacific Digestive Week
    • 発表場所
      Kobe Convention Center, Kobe, Japan.
    • 年月日
      2016-11-02 – 2016-11-05
    • 国際学会
  • [学会発表] Esomeprazole- or rabeprazole-based triple therapy eradicated Helicobacter pylori comparably regardless of clarithromycin susceptibility and CYP2C19 genotypes2016

    • 著者名/発表者名
      Tadayoshi Okimoto, Kazuhiro Mizukami, Ryo Ogawa, Kazuhisa Okamoto, Mitsutaka Shuto, Kensuke Fukuda, Masaaki Kodama, Kazunari Murakam
    • 学会等名
      ACG 2016 Annual Scientific Meeting & Postgraduate Course
    • 発表場所
      Las Vegas, NV, USA
    • 年月日
      2016-10-14 – 2016-10-19
    • 国際学会
  • [学会発表] Utility of gastroendoscopy for subjects with serum H.pylori antibody (IgG) titer equal or more than 3.0 U/ml- Study of endoscopic findings for titers between 3.0 and 9.9 U/ml (so-called “gray zone”)2016

    • 著者名/発表者名
      Shuto M, Mizukami K, Murakami K, Matsunari O, Okamoto K, Okimoto T, Kodama M, Yamaoka Y, Takigami S, Nonaka Y, Fujioka T
    • 学会等名
      XXIXth International Workshop on Helicobacter and Microbiota in Inflammation and Cancer
    • 発表場所
      Magdeburug, Germany
    • 年月日
      2016-09-15 – 2016-09-17
    • 国際学会
  • [学会発表] 第18回日本神経消化器病学会他 合同学術集会20162016

    • 著者名/発表者名
      福田健介、塩田星児、安部雄治、児玉紘祐、廣島康子、首藤充孝、岡本和久、小川竜、水上一弘、沖本忠義、兒玉雅明、村上和成
    • 学会等名
      Dyspepsia患者におけるH. pylori感染と内視鏡所見の検討
    • 発表場所
      北海道大学医学部学友会館フラテ(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-09-09 – 2016-09-10
  • [学会発表] H.pylori除菌後再出現とITP再燃例に対する検討2016

    • 著者名/発表者名
      沖本忠義、兒玉雅明、小川竜、岡本和久、水上一弘、村上和成
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-26
  • [学会発表] 陰性高値(抗体価3.0~9.9U/ml)の内視鏡所見の検討―胃癌リスク検診および内視鏡検査の有用性について―2016

    • 著者名/発表者名
      首藤充孝、村上和成、藤岡利生、岡本和久、水上一弘、沖本忠義、兒玉雅明、瀧上茂、野中良仁、下瀬裕子、伊南富士子、藤田健治、佐藤竜吾
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-26
  • [学会発表] 当院および関連施設におけるピロリ菌未感染胃癌12例のまとめとピロリ菌感染胃癌、除菌後胃癌との比較2016

    • 著者名/発表者名
      岡本和久、兒玉雅明、沖本忠義、小川竜、首藤充孝、水上一弘、上尾哲也、石田哲也、後藤康彦、香川浩一、安部高志、永井敬之、新関修、福地聡士、村上和成
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-26
  • [学会発表] Helicobacter pylori血清抗体価に影響を与える因子2016

    • 著者名/発表者名
      塩田星児、村上和成、沖本忠義、兒玉雅明、山岡吉生
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-26
  • [学会発表] H. pylori除菌後発見胃癌における除菌時高リスク因子による除菌後胃癌リスクスコアの策定2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、阿部寿徳、安部高志、小川 竜、岡本和久、水上一弘、首藤充孝、相馬 渉、永井敬之、有田 毅、村上和成
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-24
  • [学会発表] H. pylori除菌前後における内視鏡学的胃粘膜萎縮分類と組織学的萎縮・腸上皮化生との相関の変化に関する検討2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、小川 竜、岡本和久、松成 修、水上一弘、村上和成
    • 学会等名
      第22回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • 発表場所
      別府コンベンションセンター(大分県別府市)
    • 年月日
      2016-06-24 – 2016-06-24
  • [学会発表] 早期癌と進行癌の臨床病理学的差異の検討2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、村上和成
    • 学会等名
      第91回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      新高輪プリンスホテル(東京都港区)
    • 年月日
      2016-05-13 – 2016-05-13
  • [学会発表] 食道アカラシア診断とPOEM治療成績2016

    • 著者名/発表者名
      小川竜、安部高志、首藤充孝、岡本和久、水上一弘、沖本忠義、兒玉雅明、村上和成
    • 学会等名
      第91回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      新高輪プリンスホテル(東京都港区)
    • 年月日
      2016-05-12 – 2016-05-14
  • [学会発表] 高齢者の胃腫瘍性病変に対する内視鏡的粘膜下層剥離術(ESD)の有用性の検討2016

    • 著者名/発表者名
      首藤充孝、水上一弘、村上和成、本田俊一郎、福田昌英、岡本和久、小川竜、沖本忠義、兒玉雅明、安部高志、中嶋宏、永井敬之、小野英樹
    • 学会等名
      第91回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      新高輪プリンスホテル(東京都港区)
    • 年月日
      2016-05-12 – 2016-05-14
  • [学会発表] 除菌後長期背景粘膜の経過を観察し得た,除菌後12年目に発見された除菌後胃癌の1例2016

    • 著者名/発表者名
      柳井優香、上尾哲也、米増博俊、石田哲也、児玉雅明、和田蔵人、井上翔太郎、本田秀穂、垣迫陽子、本村充輝、成田竜一、畑万里子、沖本忠義、村上和成
    • 学会等名
      第91回日本消化器内視鏡学会総会
    • 発表場所
      新高輪プリンスホテル(東京都港区)
    • 年月日
      2016-05-12 – 2016-05-14
  • [学会発表] ボノプラザン(タケキャブ)を用いた除菌治療の成績2016

    • 著者名/発表者名
      松成修、木下慶亮、沖本忠義、兒玉雅明、中島仁典、村上和成
    • 学会等名
      第102回日本消化器病学会総会
    • 発表場所
      京王プラザホテル (東京都新宿区)
    • 年月日
      2016-04-21 – 2016-04-23
  • [学会発表] 胃癌におけるMEK阻害剤への感受性予測因子の探索2016

    • 著者名/発表者名
      平下有香、塚本善之、小川竜、水上一弘、本田浩一、沖本忠義、兒玉雅明、清家正隆、守山正胤、村上和成
    • 学会等名
      第102回日本消化器病学会総会
    • 発表場所
      京王プラザホテル (東京都新宿区)
    • 年月日
      2016-04-21 – 2016-04-23
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いたH. pylori 除菌後胃癌の網羅的遺伝子解析による除菌後胃癌危険因子の検討2016

    • 著者名/発表者名
      兒玉雅明、沖本忠義、村上和成
    • 学会等名
      第102回日本消化器病学会総会
    • 発表場所
      京王プラザホテル (東京都新宿区)
    • 年月日
      2016-04-21 – 2016-04-21

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公開日: 2018-01-16  

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