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肝臓で生合成された一次胆汁酸は，ヒトの腸内細菌によって二次胆汁酸へと代謝される。従って，個人の便中および血中の胆汁酸組成を調べると，その人の腸内細菌叢がわかるのではないかと考えた。我々は，健常者および各種消化器疾患患者の便と血清を収集し，便中の腸内細菌組成を末端標識制限酵素断片多型分析（T-RFLP）法にて，また便および血清の胆汁酸分画分析を高速液体クロマトグラフィー・タンデムマススペクトロメトリー（HPLC-MS/MS）法にて分析した。その結果，便中，さらには血中胆汁酸のうち，ある種の腸内細菌クラスターの比率を反映するものが見出され，臨床的に有用なバイオマーカーになることが明らかになった。
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