肺高血圧症合併間質性肺炎における、肺細動脈のトランスクリプトーム解析

2015 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 26461187
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 半田 知宏 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (10432395)
• 研究分担者: 佐藤 史顕 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20467426) ; 伊達 洋至 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60252962)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: 間質性肺炎 / 肺高血圧症

研究実績の概要

外科的肺生検、あるいは肺移植を施行した特発性肺線維症13例、膠原病性間質性肺炎3例、慢性過敏性肺炎2例、特発性肺動脈性肺高血圧症3例において、パラフィン包埋組織から薄切切片を作成した。
一部の組織でマイクロダイセクション（一部用手的に採取）を用いた肺動脈組織の抽出を行ったが、RNA抽出量が少なく、今後RNA増幅を行う予定である。
抽出量が少なくマイクロアレイが難しい場合、ターゲットとなるRNAを絞った解析も検討する。
自験例の検討により、特発性肺線維症では血中のMMP-7、MMP-10をはじめとするいくつかのMMPｓが上昇しており、その値が重症度や予後と関連する事を確認している（Sokai A et al. Respir Res 2015）。
肺高血圧症においてもMMPｓが病態に関与する事が確認されており(Chelladurai P et al. Eur Respir J 2012)、肺高血圧症合併間質性肺炎の肺動脈組織で発現が亢進している事が推測される。
MMPｓのmRNA発現定量、組織の免疫染色を予定している。

現在までの達成度 (区分)

4: 遅れている

理由

RNA保存液を用いて保存した組織からの薄切切片作成が困難であった。
パラフィン包埋組織から肺動脈組織の抽出を行っているが、これまでのところRNA抽出量が不十分であり、RNA増幅を予定している。

今後の研究の推進方策

RNA増幅を試みる。
マイクロアレイで有意なRNAが確認されれば、RNAの定量化、蛋白の発現確認を行う。
マイクロアレイ解析に十分なRNAが得られない場合はMMPｓにターゲットを絞った検討も予定している。

次年度使用額が生じた理由

組織からのRNA抽出量が不十分であり、予定の解析が進んでいないため。

次年度使用額の使用計画

RNA増幅を行い、可能であればマイクロアレイ解析を行う。そのためのアレイチップ、試薬費用に充てる。
マイクロアレイに十分な検体が得られない場合、ターゲットRNAの定量化、免疫染色の試薬費用に充てる。

研究成果

• [雑誌論文] Serial perfusion in native lungs in patients with idiopathic pulmonary fibrosis and other interstitial lung diseases after single lung transplantation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sokai A, Handa T, Chen F, Tanizawa K, Aoyama A, Kubo T, Ikezoe K, Nakatsuka Y, Oguma T, Hirai T, Nagai S, Chin K, Date H, Mishima M.
  • 雑誌名: Clin Transplant. 巻: 30 ページ: 407-414
  • DOI: 10.1111/ctr.12701.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Total lesion glycolysis as an IgG4-related disease activity marker. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakatsuka Y, Handa T, Nakamoto Y, Nobashi T, Yoshihuji H, Tanizawa K, Ikezoe K, Sokai A, Kubo T, Hirai T, Chin K, Togashi K, Mimori T, Mishima M.
  • 雑誌名: Mod Rheumatol. 巻: 25 ページ: 579-584
  • DOI: 10.3109/14397595.2014.990674.
  • 査読あり
• [雑誌論文] A toll-like receptor 3 single nucleotide polymorphism in Japanese patients with sarcoidosis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ikezoe K, Handa T, Tanizawa K, Kubo T, Ito I, Sokai A, Nakatsuka Y, Nagai S, Izumi T, Mishima M.
  • 雑誌名: Tissue Antigens. 巻: 85 ページ: 204-208
  • DOI: 10.1111/tan.12535.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Bone mineral density in patients with idiopathic pulmonary fibrosis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ikezoe K, Handa T, Tanizawa K, Kubo T, Oguma T, Hamada S, Watanabe K, Aihara K, Sokai A, Nakatsuka Y, Muro S, Nagai S, Uno K, Chin K, Fukui M, Hirai T, Mishima M.
  • 雑誌名: Respir Med. 巻: 109 ページ: 1181-1187
  • DOI: 10.1016/j.rmed.2015.06.014.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Clinical impact of high-attenuation and cystic areas on computed tomography in fibrotic idiopathic interstitial pneumonias. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tanizawa K, Handa T, Nagai S, Hirai T, Kubo T, Oguma T, Ito I, Ito Y, Watanabe K, Aihara K, Ikezoe K, Oga T, Chin K, Izumi T, Mishima M.
  • 雑誌名: BMC Pulm Med. 巻: 15 ページ: 74
  • DOI: 10.1186/s12890-015-0069-0.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Matrix metalloproteinase-10: a novel biomarker for idiopathic pulmonary fibrosis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sokai A, Handa T, Tanizawa K, Oga T, Uno K, Tsuruyama T, Kubo T, Ikezoe K, Nakatsuka Y, Tanimura K, Muro S, Hirai T, Nagai S, Chin K, Mishima M.
  • 雑誌名: Respir Res. 巻: 16 ページ: 120
  • DOI: 10.1186/s12931-015-0280-9.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] A comprehensive evaluation of serum matrix metalloproteinases in idiopathic pulmonary fibrosis (2015)
  • 著者名/発表者名: ２３.Akihiko Sokai, Tomohiro Handa, Kiminobu Tanizawa, Kazuko Uno, Toru Oga, Kohei Ikezoe, Yoshinari Nakatsuka, Toyohiro Hirai, Sonoko Nagai, Kazuo Chin, Michiaki Mishima.
  • 学会等名: American Thoracic Society International Conference.
  • 発表場所: Denver, USA
  • 年月日: 2015-05-17 – 2015-05-17
  • 国際学会
• [学会発表] 特発性肺線維症におけるマトリックスメタロプロテイナーゼのバイオマーカーとしての有用性の検討 (2015)
  • 著者名/発表者名: 5.祖開暁彦、半田知宏、谷澤公伸、小賀徹、宇野賀津子、池添浩平、中塚賀也、平井豊博、長井苑子、陳和夫、三嶋理晃
  • 学会等名: 第55回日本呼吸器学会学術講演会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-04-19 – 2015-04-19