次世代シークエンサを用いた胸腺癌新規治療標的遺伝子の同定

2016 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 26461206
• 研究機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 藤原 豊 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (70464261)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: thymic carcinoma / TET2 / DNA methylation

研究実績の概要

1973年から2014年に国立がん研究センター中央病院にて治療を受けた胸腺癌64例の臨床経過を明らかにし、またFFPE検体52例について癌関連遺伝子のTarget sequenicingを行い、既知のがん関連遺伝子の異常を探索した。7例(13.5%)において遺伝子異常が認められ、その内訳はTP53(7.5%)、KRAS(3.8%)、FBXW7(3.8%)、NRAS(1.9%)であった。2例でTP53とKRAS、TP53とFBXW7の重複変異を認めた。本研究結果はLung Cancer誌にて2016年に公表された。 Asao T, Fujiwara Y, and et al. Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. Lung Cancer. 2016 Mar;93:77-81.
腫瘍組織と正常組織の凍結組織が利用可能であった10例のSampleに対して次世代シークエンサーを用いた全エクソンシークエンス解析、全RNAシークエンス解析を行った。その結果CpG dinucleotidesでのC>T substitutionsを高率に認めた。TET2変異を10例中3例に認め、TET2変異を有する胸腺癌では高度メチル化された遺伝子を有していた。これらの結果は現在投稿中である。

研究成果

• [雑誌論文] Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Asao T, Fujiwara Y, Sunami K, Kitahara S, Goto Y, Kanda S, Horinouchi H, Nokihara H, Yamamoto N, Ichikawa H, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Takahashi K, Ohe Y.
  • 雑誌名: Lung Cancer 巻: 93 ページ: 77-81
  • DOI: 10.1016/j.lungcan.2016.01.004
  • 査読あり / 謝辞記載あり