研究課題
神経芽腫は自然退縮する予後良好タイプがある一方で、難治性の予後不良タイプは依然として治癒率が低く、様々な臨床経過がみられる腫瘍である。本研究では、これらの臨床経過の異なるサブグループ毎に網羅的ゲノムコピー数解析や網羅的遺伝子発現解析の結果に、次世代シーケンサーによる遺伝子変異解析、RNAシーケンス解析、メチローム解析を組み合わせた詳細な解析を行い、腫瘍悪性度や臨床予後などと強く関連する遺伝子の同定、新しい神経芽腫リスク分類システムの構築を目的とする。平成28年度は、前年度までに行ったアレイCGH法による腫瘍組織のゲノムコピー数解析を用いて、症例をゲノムサブグループに分類し、MYCN増幅例で特に染色体部分的増加／欠失を伴う群（Pa群、17例）と、目立ったゲノムコピー数変化の見られないサイレント群（Ss群、20例）を含む計57例について網羅的変異解析を行った。シークエンシングは読み取り深度75以上で行った。検出されたアミノ酸を伴う変異はMYCN増幅群において有意に多く（Pa:13.8/tumor、Ss:1.2/tumor）、再発時腫瘍においては58とさらに増加していることが示された。また、その変異の数は発症時月齢が高いほど多い傾向が見られた（p=0.024）。変異遺伝子のアノテーションとパスウェイ解析ではPa腫瘍の変異遺伝子はMAPKパスウェイ、Wntパスウェイに含まれる遺伝子群やaxon guidanceに関係する遺伝子群にエンリッチされていることが示された。これらの中にはNRAS活性化変異など他の進行腫瘍でも報告されているものが含まれ、今後の治療法開発に寄与すると期待された。
すべて 2017 2016
すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 3件)
Oncotarget
巻: 印刷中 ページ: 印刷中
Biochem Biophys Res Commun.
巻: 478 ページ: 81-86
10.1016/j.bbrc.2016.07.089
Sci Rep
巻: 6 ページ: 32682
10.1038/srep32682.
