次世代シークエンサーのメタゲノミック解析を用いた新生児感染症の病原微生物の同定

2016 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 26461632
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 森岡 一朗 神戸大学, 医学研究科, 特命教授 (80437467)
• 研究分担者: 池田 真理子 (谷口) 神戸大学, 医学研究科, 特命准教授 (00410738) ; 竹島 泰弘 神戸大学, 医学研究科, 客員教授 (40281141)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: 次世代シークエンサー / メタゲノミック診断法 / 周産期・新生児感染症 / 小児感染症

研究実績の概要

本研究の目的は、周産期新生児感染症において次世代シークエンサーを用いたメタゲノミック診断法を確立し、今まで同定が困難だった病原微生物の同定を行うことを目指した。
平成26年度に、本研究課題内容に関して神戸大学大学院医学研究科遺伝子解析研究倫理審査委員会の承認を得（no. 104、平成26年9月29日付）、研究のセットアップと、すでに病原微生物を同定できている既存サンプルを用いて、次世代シークエンサーによるメタゲノミック解析（後ろ向き解析）で同定できることを確認した。
平成27年度は、正常分娩であっても、分娩方法の違い（経腟分娩か帝王切開か）によって細菌叢が異なるかを検出するために、患者の同意のもと、種々の分娩方法での胎盤および臍帯を計8検体ずつ収集し解析を試みた。また、先天性細菌感染症発症の胎盤を2検体収集し解析を試みた。さらなる次世代シークエンサーでの解析技術の習得を行った。
平成28年度は、次世代シークエンサー解析技術を含む感染症の病原微生物のゲノム解析を行い、周産期新生児および小児感染症に関連する研究成果発表を行った。
今回の科研費での研究を基に周産期新生児および小児感染症領域の病原微生物を検出するための次世代シークエンサーを用いたメタゲノミック診断法の応用や実用化を目指す。また、藤田保健衛生大学総合医科学研究所分子遺伝学教室倉橋浩樹教授や兵庫県衛生研究所感染症部との共同研究体制も構築できた。

研究成果

• [雑誌論文] Changes in the numbers of patients with acute gastroenteritis after voluntary introduction of the rotavirus vaccine in a Japanese children’s primary emergency medical center. (2017)
  • 著者名/発表者名: Morioka I, Kamiyoshi N, Nishiyama M, Yamamura T, Minamikawa S, Iwatani S, Nagase H, Nozu K, Nishimura N, Taniguchi-Ikeda M, Ishibashi K, Ishida A, Iijima K
  • 雑誌名: Environ Health Prev Med. 巻: 22 ページ: 15
  • DOI: doi: 10.1186/s12199-017-0638-3.
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Novel missense mutation in DLL4 in a Japanese sporadic case of Adams-Oliver syndrome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nagasaka M, Taniguchi-Ikeda M, Inagaki H, Ouchi Y, Kuroda D, Yamana K, Harada R, Nozu K, Sakai Y, Morikoka I, Toda T, Kurahashi H, Iijima K
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: In process
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case of harlequin ichthyosis with a favorable outcome: early treatment and novel, differentially expressed, alternatively spliced transcripts of the ATP-binding cassette sub-family A member 12 gene. (2017)
  • 著者名/発表者名: Washio K, Sumi M, Nakata K, Fukunaga A, Yamana K, Koda T, Morioka I, Nishigori C, Yamanishi K
  • 雑誌名: J Dermatol. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: In process
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of contiguous gene deletions in COL4A6 and COL4A5 in Alport syndrome-diffuse leiomyomatosis. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nozu K, Minamikawa S, Yamada S, Oka M, Yanagita M, Morisada N, Fujinaga S, Nagano C, Gotoh Y, Takahashi E, Morishita T, Yamamura T, Ninchoji T, Kaito H, Morioka I, Nakanishi K, Vorechovsky I, Iijima K
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: doi: 10.1038/jhg.2017.28.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] A birth of bipartite exon by intragenic deletion. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nozu K, Iijima K, Igarashi T, Yamada S, Kralovicova J, Nozu Y, Yamamura T, Minamikawa S, Morioka I, Ninchoji T, Kaito H, Nakanishi K, Vorechovsky I
  • 雑誌名: Mol Genet Genomic Med. 巻: 印刷中 ページ: 印刷中
  • DOI: doi: 10.1002/mgg3.277
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Prediction of congenital cytomegalovirus infection in high-risk pregnant women. (2017)
  • 著者名/発表者名: Tanimura K, Tairaku S, Ebina Y, Morioka I, Nagamata S, Deguchi K, Morizane M, Deguchi M, Minematsu T, Yamada H
  • 雑誌名: Clin Infect Dis. 巻: 64 ページ: 159-165
  • DOI: doi: 10.1093/cid/ciw707.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cryptic exon activation in SLC12A3 in Gitelman syndrome. (2017)
  • 著者名/発表者名: Nozu K, Nozu Y, Nakanishi K, Konomoto T, Horinouchi T, Shono A, Morisada N, Minamikawa S, Yamamura T, Fujimura J, Nakanishi K, Ninchoji T, Kaito H, Morioka I, Taniguchi-Ikeda M, Vorechovsky I, Iijima K
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 62 ページ: 335-337
  • DOI: doi: 10.1038/jhg.2016.129.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Rare renal ciliopathies in non-consanguineous families identified by targeted resequencing. (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamamura T, Morisada N, Nozu K, Ishimori S, Toyoshima D, Ninchoji T, Yasui M, Taniguchi-Ikeda M, Morioka I, Nakanishi K, Nishio H, Iijima K
  • 雑誌名: Clin Exp Nephrol. 巻: 21 ページ: 136-142
  • DOI: doi: 10.1007/s10157-016-1256-x.
  • 査読あり
• [雑誌論文] 妊娠・分娩・産褥期の対応：サイトメガロウイルス (2017)
  • 著者名/発表者名: 山田秀人、谷村憲司、出口雅士、蝦名康彦、森岡一朗、峰松俊夫
  • 雑誌名: 周産期医学 巻: 47 ページ: 213-218
• [雑誌論文] 新生児への対応：サイトメガロウイルス (2017)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗
  • 雑誌名: 周産期医学 巻: 47 ページ: 261-264
• [雑誌論文] 先天異常を引き起こす新興母子ウイルス感染症-先天性ジカウイルス感染症 (2017)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 260 ページ: 221-225
• [雑誌論文] Comprehensive analysis of serum cytokines/chemokines in febrile children with primary human herpes virus-6B infection. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nagasaka M, Morioka I, Kawabata A, Yamagishi Y, Iwatani S, Taniguchi-Ikeda M, Ishida A, Iijima K, Mori Y
  • 雑誌名: J Infect Chemother. 巻: 22 ページ: 593-598
  • DOI: doi: 10.1016/j.jiac.2016.05.010.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An unusual case of congenital cytomegalovirus infection related retinopathy. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tagami M, Honda S, Morioka I, Iijima K, Yamada H, Nakamura M.
  • 雑誌名: BMC Ophthalmol. 巻: 16 ページ: 81
  • DOI: doi: 10.1186/s12886-016-0246-9.
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A pediatric patient with interstitial pneumonia due to enterovirus D68. (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto M, Awano H, Ogi M, Tomioka K, Unzaki A, Nishiyama M, Toyoshima D, Taniguchi-Ikeda M, Ishida A, Nagase H, Morioka I, Iijima K
  • 雑誌名: J Infect Chemother. 巻: 22 ページ: 712-715
  • DOI: doi: 10.1016/j.jiac.2016.03.009.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Next generation sequencing discloses a nonsense mutation in the dystrophin gene from long preserved dried umbilical cord and low-level somatic mosaicism in the proband mother. (2016)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi-Ikeda M, Takeshima Y, LeeT, Emoto T, Nishiyama M, Awano H, Yagi M, Unzaki A, Nozu K, Nishio H, Matsuo M, Kurahashi H, Toda T, Morioka I, Iijima K
  • 雑誌名: J Hum Genet. 巻: 61 ページ: 351-355
  • DOI: doi: 10.1038/jhg.2015.157.
  • 査読あり
• [雑誌論文] 母子に影響を与える感染症、トキソプラズマ感染症 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山田秀人、出口雅士、森岡一朗、谷村憲司、蝦名康彦、峰松俊夫
  • 雑誌名: 産婦人科の実際 巻: 65 ページ: 1719-1724
• [雑誌論文] FGRを伴う先天性サイトメガロウイルス感染の診断と管理：出生児の神経学的予後を含めて (2016)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗、西田浩輔、山田秀人
  • 雑誌名: 臨床婦人科産科 巻: 70 ページ: 938-943
• [雑誌論文] 妊娠と感染症―母児のリスクとベネフィットを考慮した薬物治療の実践―サイトメガロウイルス母子感染 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山田秀人、森岡一朗
  • 雑誌名: 薬局 巻: 67 ページ: 47-52
• [雑誌論文] 小児の感染症 この10年間の変化を中心に、新生児における感染症 (2016)
  • 著者名/発表者名: 岩谷壮太、森岡一朗
  • 雑誌名: 小児科 巻: 57 ページ: 702-708
• [学会発表] 症候性てんかんと新生児期に重篤な心機能障害を認めた兄弟例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 長坂美和子、池田真理子、稲垣秀人、大内雄矢、西山将広、粟野宏之、永瀬裕朗、森岡一朗、戸田達史、倉橋浩樹、飯島一誠
  • 学会等名: 第39回日本小児遺伝学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-12-09 – 2016-12-10
• [学会発表] Small for gestational ageで出生した先天性サイトメガロウイルス感染児の神経学的予後 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田浩輔、森岡一朗、山田秀人
  • 学会等名: 第31回日本生殖免疫学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-12-02 – 2016-12-03
• [学会発表] 妊婦のサイトメガロウイルス抗体スクリーニングの有用性 (2016)
  • 著者名/発表者名: 平久進也、谷村憲司、森岡一朗、尾崎可奈、長又哲史、森實真由美、出口雅士、蝦名康彦、峰松俊夫、山田秀人
  • 学会等名: 第31回日本生殖免疫学会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-12-02 – 2016-12-03
• [学会発表] Small for gestational ageを伴った先天性サイトメガロウイルス感染児の神経学的予後 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田浩輔、大山正平、福嶋祥代、山名啓司、黒川大輔、岩谷壮太、藤岡一路、飯島一誠、森岡一朗
  • 学会等名: 第61回日本新生児成育医学会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2016-12-01 – 2016-12-03
• [学会発表] Comprehensive analysis of serum cytokines/chemokines in febrile children with primary human herpes virus-6B infection. (2016)
  • 著者名/発表者名: Morioka I, Nagasaka M, Kawabata A, Yamagishi Y, Iwatani S, Taniguchi-Ikeda M, Ishida A, Iijima K, Mori Y
  • 学会等名: 12nd Congress of Asian Society for Pediatric Research
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
  • 年月日: 2016-11-10 – 2016-11-11
  • 国際学会
• [学会発表] Changes in patients with acute gastroenteritis after voluntary introduction of rotavirus vaccine in a Japanese children’s primary emergency medical center. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kamiyoshi N, Iwatani S, Nishiyama M, Yamamura T, Minamikawa S, Taniguchi-Ikeda M, Ishibashi K, Iijima K, Ishida A, Morioka I
  • 学会等名: 12nd Congress of Asian Society for Pediatric Research
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
  • 年月日: 2016-11-10 – 2016-11-11
  • 国際学会
• [学会発表] A pediatric patient with interstitial pneumonia due to enterovirus D68. (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto M, Awano H, Ogi M, Tomioka K, Unzaki A, Nishiyama M, Toyoshima D, Taniguchi-Ikeda M, Ishida A, Nagase H, Morioka I, Iijima K
  • 学会等名: 12nd Congress of Asian Society for Pediatric Research
  • 発表場所: Bangkok, Thailand
  • 年月日: 2016-11-10 – 2016-11-11
  • 国際学会
• [学会発表] IgG avidity とPCR 法を用いたサイトメガロウイルス妊婦スクリーニング (2016)
  • 著者名/発表者名: 平久進也、谷村憲司、森岡一朗、出口可奈、長又哲史、森實真由美、出口雅士、蝦名康彦、峰松俊夫、山田秀人
  • 学会等名: 第32回日本母性衛生学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-10-14 – 2016-10-15
• [学会発表] Countermeasures against congenital toxoplasmosis and cytomegalovirus infection led by the research team under the supervision of the Ministry of Health, Labor and Welfare in Japan. (2016)
  • 著者名/発表者名: Fujii T, Ikeda T, Inoue N, Kanayama N, Kawana T, Kimura H, Kobayashi Y, Koyano S, Masuzaki H, Matsuyama H, Minematsu T, Morioka I, Moriuchi H, Oka A, Saito S, Samejima H, Suzutani T, Yamada H, Yoshikawa T
  • 学会等名: CMV Public Health & Policy Conference
  • 発表場所: Austin, Texas, USA
  • 年月日: 2016-09-26 – 2016-09-27
  • 国際学会
• [学会発表] サイトメガロウイルスによる乳児肝炎との鑑別に苦慮した胆道閉鎖症の一例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 福嶋志穂、起塚 庸、大西 聡、橋村裕也、林 振作、内山敬達、南 宏尚、森岡一朗、冨岡雄一郎、津川二郎、棚野晃秀、西島栄治
  • 学会等名: 第43回日本小児栄養消化器肝臓学会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2016-09-16 – 2016-09-18
• [学会発表] Age-specific percentile-based reference curve of serum procalcitonin concentrations in Japanese preterm infants. (2016)
  • 著者名/発表者名: Fukuzumi N, Osawa K, Sato I, Ishino R, Hayashi N, Morioka I, Saegusa J
  • 学会等名: 32nd World Congress of Biomedical Laboratory Science
  • 発表場所: Kobe, Japan
  • 年月日: 2016-08-31 – 2016-09-04
  • 国際学会
• [学会発表] サイトメガロウイルス非初感染例での先天性感染発生予測因子の検討 (2016)
  • 著者名/発表者名: 出口雅士、平久進也、谷村憲司、森岡一朗、出口可奈、長又哲史、森實真由美、蝦名康彦、峰松俊夫、山田秀人
  • 学会等名: 第39回日本母体胎児医学会
  • 発表場所: 福島
  • 年月日: 2016-08-27 – 2016-08-28
• [学会発表] 早産児における血清プロカルシトニン値の出生後の経時的変化の特徴と基準曲線の作成 (2016)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗、岩谷壮太、福嶋祥代、德田央士、西田浩輔、前山花織, 山名啓司、黒川大輔、長坂美和子、香田 翼、飯島一誠
  • 学会等名: 第52回日本周産期・新生児医学会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2016-07-16 – 2016-07-18
• [学会発表] 本邦におけるパルボウイルスB19母子感染の実態 (2016)
  • 著者名/発表者名: 蝦名康彦、平久進也、森岡一朗、出口雅士、谷村憲司、森實真由美、山田秀人
  • 学会等名: 第52回日本周産期・新生児医学会
  • 発表場所: 富山
  • 年月日: 2016-07-16 – 2016-07-18
• [学会発表] Mycoplasma hominisによる子宮内感染から新生児遷延性肺高血圧症を呈した早産児の1例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗、前山花織、岩谷壮太、出口可奈、谷村憲司、出口雅士、飯島一誠、山田秀人
  • 学会等名: 第32回日本産婦人科感染症学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-07-10 – 2016-07-10
• [学会発表] IgG avidity とPCR 法を用いたサイトメガロウイルス妊婦スクリーニング (2016)
  • 著者名/発表者名: 平久進也、谷村憲司、森岡一朗、出口可奈、長又哲史、森實真由美、出口雅士、蝦名康彦、峰松俊夫、山田秀人
  • 学会等名: 第32回日本産婦人科感染症学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2016-07-10 – 2016-07-10
• [学会発表] 1次小児救急施設の2歳以下の感染性胃腸炎の受診児と重症児数：2011～2014年の変遷 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神吉直宙、西山将広、岩谷壮太、池田真理子、石橋和人、飯島一誠、石田明人、森岡一朗
  • 学会等名: 第30回日本小児救急医学会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2016-07-01 – 2016-07-02
• [学会発表] 1次小児救急施設の2歳以下の感染性胃腸炎の受診児と重症児数：ウイルス流行時期での比較 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神吉直宙、西山将広、岩谷壮太、池田真理子、石橋和人、飯島一誠、石田明人、森岡一朗
  • 学会等名: 第30回日本小児救急医学会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2016-07-01 – 2016-07-02
• [学会発表] 間質性肺炎を発症したエンテロウイルスD68感染症の1例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 松本真明、粟野宏之、荻美貴、冨岡和美、運崎愛、西山将広、豊嶋大作、池田真理子、石田明人、永瀬裕朗、森岡一朗、飯島一誠
  • 学会等名: 第30回日本小児救急医学会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2016-07-01 – 2016-07-02
• [学会発表] 本邦におけるパルボウイルスB19母子感染の実態 (2016)
  • 著者名/発表者名: 蝦名康彦、平久進也、森岡一朗、出口雅士、谷村憲司、森實真由美、山田秀人
  • 学会等名: 第26回日本産婦人科・新生児血液学会
  • 発表場所: 長崎
  • 年月日: 2016-07-01 – 2016-07-02
• [学会発表] IgG avidityとPCR法を用いたサイトメガロウイルス妊婦スクリーニング (2016)
  • 著者名/発表者名: 平久進也、谷村憲司、森岡一朗、長又哲史、出口雅士、蝦名康彦、峰松俊夫、山田秀人
  • 学会等名: 第134回近畿産科婦人科学会学術集会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2016-06-04 – 2016-06-05
• [学会発表] 胎児腹水を呈した症候性先天性サイトメガロウイルス感染症の3例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田浩輔、大山正平、福嶋祥代、前山花織, 山名啓司、黒川大輔、藤岡一路、岩谷壮太、森岡一朗、飯島一誠
  • 学会等名: 第268回日本小児科学会兵庫県地方会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2016-05-28 – 2016-05-28
• [学会発表] 診断に難渋したtranscriptomopathyの3例 (2016)
  • 著者名/発表者名: 運﨑 愛、池田真理子、稲垣秀人、上田雅章、森貞直哉、岡本伸彦、森岡一朗、戸田達史、倉橋浩樹、飯島一誠
  • 学会等名: 第119回日本小児科学会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2016-05-13 – 2016-05-15
• [学会発表] 先天性サイトメガロウイルス感染症児における生後早期の頭部MRI所見 (2016)
  • 著者名/発表者名: 西田浩輔、森岡一朗、出口雅士、谷村憲司、平久進也、蝦名康彦、山田秀人
  • 学会等名: 第68回日本産科婦人科学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2016-04-21 – 2016-04-24
• [学会発表] The effect of maternal screening for HBV and perinatal HBV prevention program (2016)
  • 著者名/発表者名: Yuki Sasagawa, Masashi Deguchi, Akiko Takeda, Kenji Tanimura, Mayumi Morizane, Ichiro Morioka, Hideto Yamada
  • 学会等名: 第68回日本産科婦人科学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2016-04-21 – 2016-04-24
• [学会発表] Maternal blood screening for congenital cytomegalovirus infection of the infants (2016)
  • 著者名/発表者名: Shinya Tairaku, Kenji Tanimura, Ichiro Morioka, Satoshi Nagamata, Masashi Deguchi, Yasuhiko Ebina, Toshio Minematsu, Hideto Yamada
  • 学会等名: 第68回日本産科婦人科学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2016-04-21 – 2016-04-24
• [学会発表] Advantage of next generation sequencing in molecular diagnosis in DMD -mutation screening with long preserved dried umbilical cord and detection of mosaicism-. (2016)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi-Ikeda M, Unzaki A, Takeshima Y, Lee T, Awano H, Yagi M, Kurahashi H, Morioka I, Toda T, Matsuo M, Iijima K
  • 学会等名: 13th International Congress of Human Genetics
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2016-04-03 – 2016-04-07
  • 国際学会
• [図書] 周産期医学必修知識第8版 新生児[疾患] 208サイトメガロウイルス感染症 (2016)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗、西田浩輔
  • 総ページ数: 3
  • 出版者: 東京医学社
• [図書] 改訂第2版 症例から学ぶ周産期診療ワークブック、Ⅱ. 胎児編、4. 母子感染症、6) HBV, HCV (2016)
  • 著者名/発表者名: 森岡一朗
  • 総ページ数: 7
  • 出版者: メジカルビュー社
• [備考] 神戸大学大学院医学研究科 内科系講座小児科学分野
  • URL: http://www.med.kobe-u.ac.jp/pediat/