| 研究課題/領域番号 |
26462136
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| 研究機関 | 順天堂大学 |
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研究代表者 |
柳沼 行宏 順天堂大学, 医学部, 非常勤講師 (60338415)
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| 研究分担者 |
小見山 博光 順天堂大学, 医学部, 講師 (30348982)
高持 一矢 順天堂大学, 医学部, 准教授 (30397369)
河合 純 独立行政法人理化学研究所, 予防医療・診断技術開発プログラム, 副プログラムディレクター (30391923)
藤井 智明 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (10511420)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| キーワード | 大腸癌 / CAGE法 / 次世代シークエンサー / FANTOM / 肺転移 / 腫瘍マーカー |
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| 研究実績の概要 |
本研究では，次世代シークエンサー（NGS）を用いて大腸癌肺転移に関与する遺伝子を突き止め，既存の診断法，治療法よりも精度の高い医療，臨床応用を確立することを目的とする．本研究の分担者らによって，近年，遺伝子の転写開始点を網羅的に解析するCAGE法（cap analysis of gene expression法）が開発された．そしてこの極めて定量性の高いCAGE法により，ヒトの18万を超える転写開始点と，それに由来する転写産物の発現量の網羅的解析が行われた（FANTOM5プロジェクト）．
本研究課題では，CAGE法を用いて，肺転移を伴う大腸がん症例を対象に，がん組織のmRNA発現の網羅的解析に取り組んでいる．
本研究の結果，大腸癌患者の術前内視鏡検査において，早期に肺転移を検出するシステムを確立することが可能になれば，これまでにない治療効果が期待できる．そして，術前の化学療法の適応にも大きな影響を及ぼすことが予想され，さらに，既存のstage分類に関しても，生検の遺伝子検査を含め，新たな診断法，分類，指標を作り直すことが可能となり，現在の臨床医療に対してすぐにフィードバックできる貴重な研究である．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
現在までに，肺転移を伴う大腸がん組織検体よりRNAを抽出して，CAGE法によるライブラリ調製，NGS解析に取り組んでいる．対照群には転移を伴わない症例の検体を用い，得られた転写開始点毎の遺伝子発現データについて，多変量解析，MA-plot等による評価，有意差検定を行う予定である．
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| 今後の研究の推進方策 |
今後は，再発や予後などの臨床データを再度調査し直し，遺伝子発現データについて，多変量解析，MA-plot等による評価，有意差検定を行う予定である．
また，大腸癌の癌部について現在解析を行っているが，今後は，肺転移巣についても解析を進めていく予定である．
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| 次年度使用額が生じた理由 |
本年度は，CAGE解析のために肺転移群の臨床データを再収集した．この予後，再発を含めた臨床データより解析用の検体を抽出し，CAGE解析を行う予定である．
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| 次年度使用額の使用計画 |
抽出した肺転移巣と 原発巣のCAGE解析を行う予定である．
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