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2014 年度 実施状況報告書

次世代シークエンス解析による喫煙関連肺癌に対する新規治療標的の探索

研究課題

研究課題/領域番号 26462142
研究機関千葉県がんセンター(研究所)

研究代表者

守屋 康充  千葉県がんセンター(研究所), 呼吸器外科, 主任医長 (90375692)

研究分担者 飯笹 俊彦  千葉県がんセンター(研究所), 医療局, 診療部長 (10272303)
横井 左奈  千葉県がんセンター(研究所), がんゲノムセンター, 部長 (30372452)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード肺癌 / 喫煙関連肺癌 / 扁平上皮癌 / 遺伝子 / ゲノム / マイクロRNA / 外科
研究実績の概要

近年、分子標的治療薬の治療効果は、非喫煙者の肺腺癌におけるEGFR変異陽性例やALK転座例に著効を示し、注目を浴びている。しかし、扁平上皮癌など主に喫煙を発症要因とする肺癌(全肺癌の約60%程度)に対する分子標的治療薬は未だ開発されていない。
本研究は喫煙関連肺癌において、次世代シークエンス解析により400以上の癌関連遺伝子の全エクソン解析を行い、我々がすでに有する肺癌cDNA発現プロファイルおよびマイクロRNA発現プロファイルとの比較検討から喫煙関連肺癌の新しいシグナルパスウェイを解明し、実用化可能なレベルでの包括的な分子診断技術の開発および核酸医薬として応用できるような新規治療標的を探索することを目的とする。
現在、過去に当施設で治療を行った喫煙関連肺癌症例について、手術標本の凍結サンプルの中から癌腫瘍組織と正常組織由来のDNAを抽出精製している。現時点で、扁平上皮癌を中心に30例ほどの症例においてDNAを抽出精製し品質の確認を行っている。今後、さらに症例を追加し、DNAを抽出精製して、解析を行っていく予定である。同時に、サンプル症例の臨床情報(組織型、リンパ節転移の有無、胸膜浸潤の有無、脈管浸潤の有無、術後再発転移の有無など)に関しても収集、蓄積、解析を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

現時点で、サンプルからのDNA抽出、品質チェック、臨床情報の収集などは概ね順調に行われている。

今後の研究の推進方策

今後は、上記肺癌サンプルを用いて、第3世代次世代シークエンサーを用いたCCPパネルで400以上の癌関連遺伝子の解析し、1) Hot Spot解析、2)がん関連遺伝子の機能的変異解析、3)がん関連遺伝子の変異解析、4)がん関連遺伝子のコピーナンバー変異(CNV)解析、5)喫煙関連肺癌における新たなMutation Signatureを明らかにしていく予定である。また、ホルマリン固定パラフィン包埋ブロック(FFPE)サンプルからと凍結サンプルからのDNAの比較解析を行っていく予定である。さらに、公共のデータベースを利用して、標的タンパクコード遺伝子群の探索を行う予定である。

次年度使用額が生じた理由

当初の計画より学会出席が少なく、論文作成投稿にかかる費用が少なかったため。

次年度使用額の使用計画

学会に出席し、研究成果を報告するとともに情報収集を行い、結果を論文として投稿する予定である。

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公開日: 2016-05-27  

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