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2015 年度 実施状況報告書

次世代シークエンサーを利用した膠芽腫の治療抵抗性と再発に関連する遺伝子変異の探索

研究課題

研究課題/領域番号 26462186
研究機関熊本大学

研究代表者

秀 拓一郎  熊本大学, 医学部附属病院, 診療講師 (40421820)

研究分担者 牧野 敬史  熊本大学, 医学部附属病院, 講師 (90381011)
中村 英夫  熊本大学, 医学部附属病院, 講師 (30359963)
矢野 茂敏  熊本大学, 大学院生命科学研究部, 准教授 (60332871)
倉津 純一  熊本大学, 大学院生命科学研究部, 教授 (20145296) [辞退]
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード膠芽腫 / ディープシークエンス / 治療抵抗性 / 再発
研究実績の概要

近年、次世代シークエンサーにおける遺伝子解析が行われるようになり、これまで見過ごされていた遺伝子変異も発見できるようになった。その中で、グリオーマ研究においてIDH1変異は大変重要な発見であった。全ゲノムシークエンスは膨大なデータが取れるが、多くのサンプル数を解析するにはいまだ高価であり、また、得られる情報量が多すぎて、その解釈が困難な場合がある。そこで、比較的安価に多くの症例を解析するために、多種類の癌種で共通にみられる遺伝子変異に注目した癌パネル(イルミナ)を利用して、がん関連48遺伝子の体細胞変異ホットスポット領域(212領域)に絞ったディープシークエンスを行い、膠芽腫症例の予後、治療反応性、再発などについてレトロスペクティブに解析し、これらの条件に対する遺伝子変異マーカーとして応用を考えている。
本研究では少ない症例数から結果を得るために検討症例の条件を絞りディープシークエンスを行った。長期生存例と短期生存例の比較、同一症例で初発時と再発時、再再発時の比較、尾状核部膠芽腫と視床部膠芽腫の比較によりこれまで膠芽腫ではあまり知られていない治療抵抗性や再発に必須の遺伝子変異を発見することを本研究の目的としている。
本研究では再発例ではFFPE(パラフィン包埋切片)を用いた悪性度の高い腫瘍組織領域から正確なDNA精製を行い、ディープシークエンスを行った。
現在、長期生存例(21症例)と短期生存例(14症例)の比較、同一症例における初発時と再発時の比較(16症例)、尾状核部膠芽腫(7症例)と視床部膠芽腫(12例)のディープシークエンスをすでに終了した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

93サンプルからDNAを精製し、ディープシークエンスを行い、90サンプルからデータがえられた。3サンプルにおいてはシークエンスデータが得られなかった。
長期生存例(21症例)と短期生存例(14症例)の比較、同一症例における初発時と再発時の比較(16症例)を行い、最近話題となっている脳深部に発生する膠芽腫に対する知見を得るために、尾状核部膠芽腫(7症例)と視床部膠芽腫(12例)も検討した。変異はFrameshift変異、Misssense変異、Nonsense変異、Synonymous変異、Silent変異、Noncoding変異 で検討した。
同一症例における初発時と再発時比較(16症例)の内訳は、初発時と再発時の比較(14症例)、初発時と再発時、再再発時の比較(2症例)であり、16症例中13症例で再発時に遺伝子変異の蓄積が認められた。
今後は変異の出現頻度なども詳細に検討する予定である。

今後の研究の推進方策

90サンプルのディープシークエンスは終了している。
解析ソフトでのフィルトレーション前後での検討や遺伝子変異の種類別(Frameshift変異、Misssense変異、Nonsense変異、Synonymous変異、Silent変異、Noncoding変異)の検討、初発・再発時での変異の増加とそれぞれの変異の出現頻度の変化を解析する。
膠芽腫症例の予後予測、治療反応性、再発などについての分子マーカーの発見につなげる。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Quality of life and clinical features of long-term survivors surgically treated for pediatric craniopharyngioma.2015

    • 著者名/発表者名
      Yano S, Kudo M, Hide T, Shinojima N, Makino K, Nakamura H, Kuratsu JI.
    • 雑誌名

      World Neurosurg.

      巻: 85 ページ: 153-62

    • DOI

      10.1016/j.wneu.2015.08.059.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel metal chelating molecules with anticancer activity. Striking effect of the imidazole substitution of the histidine-pyridine-histidine system.2015

    • 著者名/発表者名
      Ali TF, Iwamaru K, Ciftci HI, Koga R, Matsumoto M, Oba Y, Kurosaki H, Fujita M, Okamoto Y, Umezawa K, Nakao M, Hide T, Makino K, Kuratsu JI, Abdel-Aziz M, Abuo-Rahma GE, Beshr EA, Otsuka M.
    • 雑誌名

      Bioorg Med Chem.

      巻: 23 ページ: 5476-82

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2015.07.044.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Ceacam1L modulates STAT3 signaling to control the proliferation of glioblastoma-initiating cells.2015

    • 著者名/発表者名
      Kaneko S, Nakatani Y, Takezaki T, Hide T, Yamashita D, Ohtsu N, Ohnishi T, Terasaka S, Houkin K, Kondo T.
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 75 ページ: 4224-34

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-15-0412.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] he Usefulness of Indocyanine Green Fluorescence Endoscope in Endonasal Transsphenoidal Surgery2015

    • 著者名/発表者名
      Hide T.,* Yano S., Shinojima N., Kuratsu J.,
    • 雑誌名

      J Neurosurg.

      巻: 122 ページ: 1185-92

    • DOI

      10.3171/2014.9.JNS14599.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A flexible endoscope-assisted interhemispheric transcallosal approach through the contralateral ventricle for the removal of a third ventricle craniopharyngioma2015

    • 著者名/発表者名
      Yano S., Hide T., Shinojima N., Ueda U., Kuratsu J
    • 雑誌名

      Surg Neurol Int.

      巻: 5 ページ: 113-6

    • DOI

      10.4103/2152-7806.153653.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 脳腫瘍のがん幹細胞2015

    • 著者名/発表者名
      秀拓一郎, 牧野敬史, 中村英夫, 矢野茂敏, 倉津純一
    • 雑誌名

      日本臨床

      巻: 73 ページ: 836-843

  • [学会発表] 視床および尾状核に発生する膠芽腫の比較2016

    • 著者名/発表者名
      秀拓一郎、矢野茂敏、篠島直樹、倉津純一
    • 学会等名
      第26回日本間脳下垂体腫瘍学会
    • 発表場所
      ザ・セレクトン福島(福島)
    • 年月日
      2016-02-19 – 2016-02-20
  • [学会発表] 膠芽腫の腫瘍本体との境界領域で高発現するmicroRNA2015

    • 著者名/発表者名
      秀拓一郎、穴井茂雄、牧野敬史、中村英夫、矢野茂敏、倉津純一
    • 学会等名
      第33回日本脳腫瘍学会
    • 発表場所
      グランドプリンスホテル京都(京都)
    • 年月日
      2015-12-06 – 2015-12-08
  • [学会発表] 膠芽腫境界部分で高発現するmicroRNA2015

    • 著者名/発表者名
      秀拓一郎、穴井茂雄、牧野敬史、中村英夫、矢野茂敏、倉津純一
    • 学会等名
      第74回日本脳神経外科学会総会
    • 発表場所
      ロイトン札幌(北海道)
    • 年月日
      2015-10-14 – 2015-10-16
  • [学会発表] 膠芽腫の克服を目指した膠芽腫幹細胞・膠芽腫幹細胞ニッチ研究の現状と未来2015

    • 著者名/発表者名
      秀拓一郎、倉津純一
    • 学会等名
      第56回日本組織細胞化学会 総会・学術集会
    • 発表場所
      関西医科大学(大阪)
    • 年月日
      2015-10-03 – 2015-10-04
    • 招待講演

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公開日: 2017-01-06  

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