網羅的ゲノム・エピゲノム解析による神経芽腫再発・治療抵抗性獲得のメカニズムの解明

2014 年度 実施状況報告書

• 研究課題/領域番号: 26462721
• 研究機関: 千葉県がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 菱木 知郎 千葉県がんセンター(研究所), 発がん研究部, 主任医長 (00375776)
• 研究分担者: 上條 岳彦 埼玉県立がんセンター(臨床腫瘍研究所), 臨床腫瘍研究所, 研究所長 (90262708) ; 吉田 英生 千葉大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (60210712)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: 神経芽腫 / 再発 / 網羅的ゲノム解析 / 網羅的エピゲノム解析

研究実績の概要

本研究は、次世代シークエンサーを用いた網羅的解析により神経芽腫が再発に至るメカニズムを解明することを目的とする。初発時および再発時の検体がセットで存在する神経芽腫症例につき、2点間のゲノム・エピゲノムレベルの変化を解析することによりクローン進化の機序を明白にし、神経芽腫が再発に至るプロセスで鍵となる分子の同定を目指す。
平成26年度は以下の研究を行った。
①倫理審査承認：共同研究に参画する３施設でそれぞれ倫理審査承認を得た。その上で初発・再発の双方の検体がペアで存在する症例を選出し、患者または患者家族の同意を得られる場合には同意を取得した。
②選出された症例の初発時サンプルに対し、従来行われてきた網羅的ゲノム解析法であるアレイCGH法を用いて神経芽腫の予後因子としてcriticalであるとされるMYCN遺伝子増幅の有無、DNA ploidy、1p loss、11q loss、17q partial gainを解析した。さらに236例の神経芽腫検体を元に作成されたgenomic signature(Tomiokaら、Oncoge 2008)を元に各症例の予後解析をおこなった。対象症例は６例あり、いずれもstage 4であった。4例はすでに腫瘍死しており、２例は再発生存中であった。MYCN増幅は5例にみとめた。Genomic signature解析は4例に対し行っており、1p lossは3例、11qLOHが2例、17q partial gainは2例に認められた。いずれも5年生存率30%以下と非常に予後の不良なグループに属する腫瘍であることがわかった。
③エクソームシークエンス解析：倫理審査承認に時間を要し、今回対象とする検体の解析を行うに至らなかった。そのため既存の検体を用い条件調整を行った。

現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

倫理審査手続きに若干予想を上回る時間を要したこと、過去の検体調整に時間を要したことが計画より遅れている原因となっている。今後挽回できる遅れと考えている。

今後の研究の推進方策

当初の予定どおり次世代シーケンサーを用いたエクソーム解析およびエピゲノム異常解析を行う予定である。

次年度使用額が生じた理由

研究に用いる試薬を不足なく購入でき、次年度以降、本格的な解析を開始するにあたりより多くの予算が必要とされると判断したため、残額14971円を次年度に使用することにしました。

次年度使用額の使用計画

サンプル調整試薬に用いる予定。

研究成果

• [雑誌論文] Receptor-type protein tyrosine phosphatase k (PTPRK) directly dephosphorylates CD133 and regulates downstream AKT activation (2015)
  • 著者名/発表者名: Osamu Shimozato, Miyuki Waraya, Kumiko Nakashima, Hiroaki Souda, Nobuhiro Takiguchi, Hiroshi Yamamoto, Hisanori Takenobu, Haruka Uehara, Eriko Ikeda, Serina Matsushita, Natsumi Kubo, Akira Nakagawara, Toshinori Ozaki, and Takehiko Kamijo
  • 雑誌名: Oncogene. 巻: 34 ページ: 1949-60.
  • DOI: 10.1038/onc.2014.141
  • 査読あり
• [雑誌論文] Correlation between the International Neuroblastoma Pathology Classification and genomic signature in neuroblastoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakazawa A, Haga C, Ohira M, Okita H, Kamijo T, Nakagawara A.
  • 雑誌名: Cancer Sci. in press 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1111/cas.12665
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Combination of carbon ion beam and gemcitabine causes irreparable DNA damage and death of radioresistant pancreatic cancer stem-like cells in vitro and in vivo. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sai S, Wakai T, Vares G, Yamada S, Kamijo T, Kamada T, Shirai T.
  • 雑誌名: Oncotarget 巻: 6 ページ: 5517-35
  • 査読あり
• [雑誌論文] 小児固形腫瘍のがん幹細胞 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上條岳彦
  • 雑誌名: 小児外科 巻: 47 ページ: 123-128
  • 査読あり
• [雑誌論文] Radioguided localization of neuroblastomas in laparoscopic surgery using 123I- radiolabeled metaiodobenzylguanidine. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T, Saito T, Terui K, Mitsunaga T, Nakata M, Hayashi H, Yoshida H.
  • 雑誌名: Pediatr Blood Cancer. 巻: 2015 ページ: 1297-1299
  • DOI: 0.1002/pbc.25488
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prognostic significance of Aminopeptidase-N (CD13) in hepatoblastoma. (2015)
  • 著者名/発表者名: Saida S, Watanabe KI, Kato I, Fujino H, Umeda K, Okamoto S, Uemoto S, Hishiki T, Yoshida H, Tanaka S, Adachi S, Niwa A, Nakahata T, Heike T.
  • 雑誌名: Pediatr Int. 巻: - ページ: -
  • DOI: 10.1111/ped.12597
  • 査読あり
• [雑誌論文] Malignant rhabdoid tumor of the liver: a case report and literature review. (2015)
  • 著者名/発表者名: Oita S, Terui K, Komatsu S, Hishiki T, Saito T, Mitsunaga T, Nakata M, Yoshida H.
  • 雑誌名: Pediatr Rep 巻: 7 ページ: 5578
  • DOI: 10.4081/pr.2015.5578
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Unique expression features of cancer-type organic anion transporting polypeptide 1B3 mRNA expression in human colon and lung cancers (2014)
  • 著者名/発表者名: Sun Y, Furihata T, Ishii S, Nagai M, Harada M, Shimozato O, Kamijo T, Motohashi S, Yoshino I, Kamiichi A, Kobayashi K, Chiba K.
  • 雑誌名: Clin Transl Med. 巻: 3 ページ: 37
  • DOI: 10.1186/s40169-014-0037-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Histological features of primary tumors after induction or high-dose chemotherapy in high-risk neuroblastoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hishiki T, Horie H, Higashimoto Y, Yotsumoto K, Komatsu S, Okimoto Y, Kakuda H, Taneyama Y, Saito T, Terui K, Mitsunaga T, Nakata M, Ochiai H, Hino M, Ando K, Yoshida H, Iwai J.
  • 雑誌名: Pediatric Surgery International 巻: 30 ページ: 919-926
  • DOI: 10.1007/s00383-014-3564-0.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Coexistence of neuroblastoma detected on staging of Langerhans cell histiocytosis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shiohama T, Ochiai H, Hishiki T, Yoshida H, Kohno Y.
  • 雑誌名: Pediatr Int. 巻: 56 ページ: 608-610
  • DOI: 10.1111/ped.12292.
  • 査読あり
• [学会発表] 半定量的MIBGスコアによる転移性神経芽腫治療反応性の判定と初期反応不良例の臨床的生物学的特徴 (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomoro Hishiki, Yasuyuki Higashimoto, Katsumi Yotsumoto, Shugo Komatsu, Yuri Okimoto, Harumi Kakuda, Yuichi Taneyama, Kazuki Furudate, Takeshi Saito, Keita Terui, Tetsuya Mitsunaga, Mitsuyuki Nakata, Hidemasa Ochiai, Moeko Koshino, Kumiko Ando, Hideo Yoshida, and Jun Iwai
  • 学会等名: 第52回日本小児血液・がん学会学術集会
  • 発表場所: 岡山市
  • 年月日: 2014-11-28 – 2014-11-30
• [学会発表] TUMOR HISTOLOGY FOLLOWING INDUCTION CHEMOTHERAPY AND / OR HIGH-DOSE CHEMOTHERAPY AND ITS IMPACT ON THE OUTCOME OF PATIENTS WITH HIGH-RISK NEUROBLASTOMA (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomoro Hishiki, Hiroshi Horie, Yasuyuki Higashimoto, Katsumi Yotsumoto, Shugo Komatsu, Yuri Okimoto, Harumi Kakuda, Yuichi Taneyama, Takeshi Saito, Keita Terui, Tetsuya Mitsunaga, Mitsuyuki Nakata, Hidemasa Ochiai, Moeko Hino, Kumiko Ando, Hideo Yoshida, and Jun Iwai
  • 学会等名: 46th annual congress of SIOP
  • 発表場所: トロント市（カナダ）
  • 年月日: 2014-10-22 – 2014-10-25
• [学会発表] 進行神経芽腫原発巣的出時の 標本における病理組織像の検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 菱木知郎、堀江 弘、東本恭幸、四本克己、小松秀吾、岩井潤 、吉田英生
  • 学会等名: 第51回日本小児外科学会学術集会
  • 発表場所: 大阪市
  • 年月日: 2014-05-08 – 2014-05-10
• [図書] 肝芽腫の診断と治療、「最新肝癌学」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上條岳彦、檜山英三
  • 総ページ数: 805-811
  • 出版者: 日本臨牀社