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2015 年度 実施状況報告書

定量リン酸化プロテオミクスによる膠芽腫幹細胞mTORシグナルの阻害攪乱機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26505001
研究機関東京大学

研究代表者

秦 裕子  東京大学, 医科学研究所, 技術専門員 (80401256)

研究分担者 尾山 大明  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (30422398)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワードプロテオミクス / 膠芽腫幹細胞 / mTOR シグナル / リン酸化 / SILAC
研究実績の概要

膠芽腫は脳腫瘍において発生頻度が最も高く、診断確定後の平均生存期間が約15箇月と報告されている極めて悪性度の高い腫瘍である。また化学療法や放射線治療に対しても高い抵抗性を示し、過去数十年にわたってその治療成績は殆ど改善されていない。
近年、膠芽腫をはじめとするある種の腫瘍においてがん幹細胞の存在が実験的に証明されている。がん幹細胞はがん組織のヒエラレルキーの頂点に立ち、高い造腫瘍能、及び自己複製能を示すことから、がんの根治のためにはがん細胞全体をターゲットとする従来の治療法を見直し、がん幹細胞に代表される造腫瘍能が高い細胞に的を絞った新たな治療戦略の展開が急務であると考えられる。
がん幹細胞の性質を維持するためにEGFが必須であると報告されていることから、我々は先行研究において質量分析計を用いた相対定量法であるSILAC法とTiO2カラムを用いたリン酸化ペプチド濃縮法を組み合わせ、患者由来膠芽腫幹細胞に関するEGF刺激依存的な大規模リン酸化プロテオーム定量解析を行った結果、当該細胞の幹細胞性維持においてmTORパスウェイが重要な働きを担うことが示唆された(Kozuka-Hata et al., PLoS One, 7: e43398, 2012)。本研究課題では、更にmTOR特異的阻害剤による当該パスウェイ下流シグナルの攪乱実験を行い、複雑な制御機構の特徴をリン酸化レベルで体系的に見出すことを目的とした。
平成26年度に取得した6,000種類を超えるリン酸化ペプチド情報に基づき、平成27年度は NetworKIN, Motif-x 等のリン酸化情報解析ツールを統合的に駆使し、ハブとなるパスウェイの抽出に成功した。また当該細胞に関して包括的な発現プロテオ―ム解析を行い、約5,000 種類の蛋白質に関する同定・定量を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

昨年度に取得した大容量リン酸化ペプチドデータに基づいて詳細なバイオインフォマティクス解析を行い、統計科学的に重要なパスウェイの抽出に成功した。更に、包括的な発現プロテオ―ム解析から、約5,000 種類の蛋白質を同定・定量した。

今後の研究の推進方策

同定した約5,000 種類の発現蛋白質に関する変動情報に基づき、IPA、 PANTHER、 STRING、DAVID 等を駆使した多角的な蛋白質情報解析を行い、すでに取得しているリン酸化情報解析結果との統合により、創薬に向けたターゲット因子やパスウェイの絞り込みを行う。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Ubiquitin-specific protease 9X in host cells interacts with herpes simplex virus 1 ICP0.2016

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Kato A, Arii J, Koyanagi N, Kozuka-Hata H, Oyama M, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      J Vet Med Sci

      巻: 78 ページ: 405-410

    • DOI

      10.1292/jvms.15-0598

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrative Network Analysis Combined with Quantitative Phosphoproteomics Reveals Transforming Growth Factor-beta Receptor type-2 (TGFBR2) as a Novel Regulator of Glioblastoma Stem Cell Properties.2016

    • 著者名/発表者名
      Narushima Y, Kozuka-Hata H, Koyama-Nasu R, Tsumoto K, Inoue J, Akiyama T, Oyama M.
    • 雑誌名

      Mol Cell Proteomics

      巻: 15 ページ: 1017-1031

    • DOI

      10.1074/mcp.M115.049999

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Cellular Transcriptional Coactivator RanBP10 and Herpes Simplex Virus 1 ICP0 Interact and Synergistically Promote Viral Gene Expression and Replication.2016

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Kato A, Maruzuru Y, Oyama M, Kozuka-Hata H, Arii J, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 90 ページ: 3173-3186

    • DOI

      10.1128/JVI.03043-15

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Long noncoding RNA UPAT promotes colon tumorigenesis by inhibiting degradation of UHRF1.2016

    • 著者名/発表者名
      Taniue K, Kurimoto A, Sugimasa H, Nasu E, Takeda Y, Iwasaki K, Nagashima T, Okada-Hatakeyama M, Oyama M, Kozuka-Hata H, Hiyoshi M, Kitayama J, Negishi L, Kawasaki Y, Akiyama T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 113 ページ: 1273-1278

    • DOI

      10.1073/pnas.1500992113

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Scaffold Protein Ahk1, Which Associates with Hkr1, Sho1, Ste11, and Pbs2, Inhibits Cross Talk Signaling from the Hkr1 Osmosensor to the Kss1 Mitogen-Activated Protein Kinase.2016

    • 著者名/発表者名
      Nishimura A, Yamamoto K, Oyama M, Kozuka-Hata H, Saito H, Tatebayashi K.
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol

      巻: 36 ページ: 1109-1123

    • DOI

      10.1128/MCB.01017-15

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Differential analyses of major allergen proteins in wild-type rice and rice producing a fragment of anti-rotavirus antibody.2016

    • 著者名/発表者名
      Yuki Y, Kurokawa S, Kozuka-Hata H, Tokuhara D, Mejima M, Kuroda M, Oyama M, Nishimaki-Mogami T, Teshima R, Kiyono H.
    • 雑誌名

      Regul Toxicol Pharmacol

      巻: 76 ページ: 128-136

    • DOI

      10.1016/j.yrtph.2016.01.023

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantitative phosphoproteomics-based molecular network description for high-resolution kinase-substrate interactome analysis.2016

    • 著者名/発表者名
      Narushima Y, Kozuka-Hata H, Tsumoto K, Inoue J, Oyama M.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1093/bioinformatics

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Phosphoproteomics-based network analysis of cancer cell signaling systems.2015

    • 著者名/発表者名
      Kozuka-Hata H and Oyama M.
    • 雑誌名

      Springer

      巻: - ページ: 3-15

    • DOI

      10.1007/978-4-431-55561-2_1

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Interactome analysis of herpes simplex virus 1 envelope glycoprotein H.2015

    • 著者名/発表者名
      Hirohata Y, Kato A, Oyama M, Kozuka-Hata H, Koyanagi N, Arii J, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      Microbiol Immunol

      巻: 59 ページ: 331-337

    • DOI

      10.1111/1348-0421.12255

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Function of the Herpes Simplex Virus 1 Small Capsid Protein VP26 Is Regulated by Phosphorylation at a Specific Site.2015

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi R, Kato A, Oda S, Koyanagi N, Oyama M, Kozuka-Hata H, Arii J, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 89 ページ: 6141-6147

    • DOI

      10.1128/JVI.00547-15

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The stability of epigenetic factor ASXL1 is regulated through ubiquitination and USP7-mediated deubiquitination.2015

    • 著者名/発表者名
      Inoue D, Nishimura K, Kozuka-Hata H, Oyama M, Kitamura T.
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 29 ページ: 2257-2260

    • DOI

      10.1038/leu.2015.90

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Herpes Simplex Virus 1 Recruits CD98 Heavy Chain and β1 Integrin to the Nuclear Membrane for Viral De-Envelopment.2015

    • 著者名/発表者名
      Hirohata Y, Arii J, Liu Z, Shindo K, Oyama M, Kozuka-Hata H, Sagara H, Kato A, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 89 ページ: 7799-7812

    • DOI

      10.1128/JVI.00741-15

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Role of Host Cell p32 in Herpes Simplex Virus 1 De-Envelopment during Viral Nuclear Egress.2015

    • 著者名/発表者名
      Liu Z, Kato A, Oyama M, Kozuka-Hata H, Arii J, Kawaguchi Y.
    • 雑誌名

      J Virol

      巻: 89 ページ: 8982-8998

    • DOI

      10.1128/JVI.01220-15

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] mTOR 阻害剤を用いた膠芽腫幹細胞プロテオーム及びリン酸化プロテオームに関する統合摂動解析2015

    • 著者名/発表者名
      秦 裕子, 廣木 朋子, 那須 亮, 津本 浩平, 井上 純一郎, 秋山 徹, 尾山 大明
    • 学会等名
      BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] 高精度定量リン酸化プロテオミクスに基づく統合ネットワーク解析による膠芽腫幹細胞分化制御因子の同定2015

    • 著者名/発表者名
      成島 悠太, 秦 裕子, 那須 亮, 津本 浩平, 井上 純一郎, 秋山 徹, 尾山 大明
    • 学会等名
      BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] IPA Advanced Analytics を活用した患者由来膠芽腫幹細胞における 蛋白質制御ネットワークの解明2015

    • 著者名/発表者名
      秦 裕子
    • 学会等名
      Ingenuity ユーザーミーティング
    • 発表場所
      大手町サンケイプラザ
    • 年月日
      2015-10-02 – 2015-10-02
    • 招待講演

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公開日: 2017-01-06  

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