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2016 年度 実績報告書

ESI-MS2スペクトルデータを用いた代謝物の化学構造推定

研究課題

研究課題/領域番号 26505013
研究機関茨城工業高等専門学校

研究代表者

蓬莱 尚幸  茨城工業高等専門学校, 電子情報工学科, 教授 (80633346)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード質量分析 / 部分構造推定 / 環構造 / プロダクトイオン
研究実績の概要

本研究では、環状部分構造とESI-MS2スペクトルの関係性を明らかにし、環構造判定能力が高いピークを用いた環状構造部分構造推定法と推定ツールを開発する。
平成26年度は、構造式に含まれるすべての環構造を抽出するツールを作成し、公開スペクトルデータベースMassBankを用いて、スペクトル内のピークの環構造判定能力を算出し、部分構造の類似度とスペクトルの類似度の間に強い相関関係があることを確認した。
平成27年度は、未同定スペクトルを入力とし、含まれるピークの環構造判定能力を合算することで環構造予測スコアを計算する手法を考案した。さらに、MassBankのスペクトルを用いて、この環構造予測スコアの予測能力(精度、再現率、F値)を計算し、いくつかの環構造について有効性を検証した。これらの結果をもとに、未同定スペクトルを入力とし、特定の環構造について環構造予測スコアを計算し、その構造を持つと予測することの精度と再現率を出力する環構造予測ツールの設計に着手した。また、MassBankにスペクトルが登録されている化合物が持つすべての環構造について、環構造予測スコアの予測能力を計算し、計算結果をデータベース化することにも着手した。このデータベースは、設計に着手した環構造予測ツールを有効活用するために必要なデータを提供する。
平成28年度は、未同定スペクトルを入力とし、特定の環構造について環構造予測スコアを計算し、その構造を持つと予測することの精度と再現率を出力する環構造予測ツールを作成し、環構造予測能力を検証した。

  • 研究成果

    (1件)

すべて 2017

すべて 学会発表 (1件)

  • [学会発表] ESIマススペクトルを用いた代謝物の環構造予測2017

    • 著者名/発表者名
      川崎聡大, 蓬莱尚幸
    • 学会等名
      日本質量分析学会第65回質量分析総合討論会
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2017-05-17 – 2017-05-17

URL: 

公開日: 2018-01-16  

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