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2015 年度 研究成果報告書

メタゲノミクスと数理統計学の融合による新規な環境影響評価法の開発

研究課題

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研究課題/領域番号 26550053
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 環境影響評価
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

高見 英人  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海底資源研究開発センター, 上席研究員 (70359165)

研究分担者 竹本 和広  九州工業大学, 情報工学研究院, 准教授 (40512356)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワード環境メタゲノム / 生理代謝機能 / 環境影響評価 / 機能モジュール / MAPLEシステム
研究成果の概要

本研究は、あらゆる環境に生息する微生物のメタゲノム解析から得られる膨大なデータをもとに環境微生物が有する様々な生理代謝機能を可視化し、数理・統計物理学的な手法やネットワーク解析を駆使して環境への影響を鋭敏に評価する方法論の開発を目的とした。具体的には既知の海洋メタゲノム配列を研究代表者らが開発中の生理代謝機能評価システム(MAPLE)を用いて環境微生物が有する様々な生理代謝機能を機能の充足率として数値化し、その数値の過大/過少評価を補正するための指標(Q値)の計算手法を考案した。また、機能の存在度の計算手法も開発し、これらの数値をもとに環境間の生理代謝機能や生物種組成の違い等を明らかにした。

自由記述の分野

ゲノム科学

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公開日: 2017-05-10  

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