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本研究では，リボソームなどで見られる3塩基認識の詳細解明を目的として，メソポーラスシリカが持つ均一メソ細孔空間を反応場とする実験系を構築し，以下の研究課題を遂行した。(1) 細孔内過冷却水を利用した短鎖DNA二重鎖の構造安定性評価：シリカメソ細孔内では3塩基認識が効率的に進行することを見いだした。(2) ループ構造を持つヘアピンループ構造の細孔内安定性：ループ部位のわずかな構造変化によって構造安定性が細孔内で低下することを見いだした。(3) 短鎖DNA二重鎖の安定性におよぼす空隙サイズの影響：サイズマッチングによる飛躍的な構造安定化を定量的に評価した。
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