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2014 年度 実施状況報告書

生体内の亜酸化窒素の産生制御と消去

研究課題

研究課題/領域番号 26620140
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

城 宜嗣  独立行政法人理化学研究所, 放射光科学総合研究センター, 主任研究員 (70183051)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード一酸化窒素 / 脱窒菌 / 嫌気呼吸 / 細胞内タンパク質複合体
研究実績の概要

一酸化窒素還元酵素NORをノックアウトした緑膿菌は、脱窒条件下(硝酸イオン存在、嫌気条件)では生育しなかった。そこに、NORをコードしたプラスミドを導入すると、緑膿菌は生育できるようになった。すなわち、緑膿菌をホストとする、NORの発現系構築に成功した。NO産生酵素である亜硝酸還元酵素とNORとの複合体の生理的意義を確認するために、両酵素の相互作用部位にあたるアミノ酸残基を変異させたNORをこの発現系に導入した。このNOR変異緑膿菌は、野生型の緑膿菌と比較して生育が遅くなった。変異により両酵素の相互作用が弱くなった結果と解釈した。このことより、NiR-NOR複合体はNOを細胞内に拡散させないシステムである事を確認した。
さらにNORとNiRと、それらへの電子供与体タンパク質である、アズリンあるいはチトクロムc551との相互作用を、スペクトルの経時変化により解析する事を開始さいた。さらに、NOR/NiR/電子供与体の三者複合体の結晶化を開始した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

緑膿菌をホストとするNOR発現系の構築成功は大変大きな成果である。これにより、今まで大腸菌をホストとしては成功していなかった変異体の調製が可能となった。この発現系を用いれば、NiR-NOR複合体の生理的な意義の解明も可能となる。

今後の研究の推進方策

基本的には今年度の方向で研究を進め、その進展を加速する。
緑膿菌をホストとするNOR発現系を用いて、複合体形成に関わるアミノ酸残基を変異させたNOR変異体を調製し、NiR-NOR複合体の生理的意義の解明につなげていきたい。蛍光ラベルしたNORならびに蛍光ラベルしたNiRを同時に緑膿菌内に発現するシステムの構築をめざす。それを用いた細胞内での両酵素の動態を蛍光顕微鏡で観察すると同時に、複合体形成を阻害する薬剤検索にも取りくむ。

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 4件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Crystal Structure, Exogenous Ligand Binding and Redox Properties of an Engineered Diiron Active Site in a Bacterial Hemerythrin2014

    • 著者名/発表者名
      A. Onoda, Y. Okamoto, H. Sugimoto, Y. Takano, S. Hirota, D. Kurtz, Y. Shiro, T. Hayashi
    • 雑誌名

      Chem. Comm.

      巻: 50 ページ: 3421-3423

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structures of Reduced and Ligand-Bound Nitric Oxide Reductase Provide Insights into Functional Differences in Respiratory Enzymes2014

    • 著者名/発表者名
      N. Sato, S. Ishii, H. Sugimoto, T. Hino, Y. Fukumori, Y. Sako, Y. Shiro, T. Tosha
    • 雑誌名

      PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics

      巻: 82 ページ: 1258-1271

    • 査読あり
  • [雑誌論文] An in vivo Inhibitory Effect on the Heme Uptake of Pseudomonas aeruginosa by Its Hemophore (HasAp) Carrying Synthetic Metal Complexes2014

    • 著者名/発表者名
      C. Shirataki, O. Shoji, M. Terada, S. Ozaki, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe
    • 雑誌名

      Angw. Chem. Int. Ed.

      巻: 53 ページ: 2862-2866

    • DOI

      10.1002/anie.200

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of Quinol-Dependent Nitric Oxide Reductase from Geobacillus Stearothermophilus: Enzymatic Activity and Active Site Structure2014

    • 著者名/発表者名
      E. Terasaka, N. Okada, N. Sato, Y. Sako, Y. Shiro, T. Tosha
    • 雑誌名

      Biochim. Biophys. Acta - Bioenergetics

      巻: 1837 ページ: 1019-1026

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Disulfide Bonds Regulate Binding of Exogenous Ligand to Human Cytoglobin2014

    • 著者名/発表者名
      H. Tsujino, T. Yamashita, A. Nose, K. Kukino, H. Sawai, Y. Shiro, T. Uno
    • 雑誌名

      J. Inor. Biochem.

      巻: 135 ページ: 20-27

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Palladium-Nanoparticle-Catalyzed 1,7-Palladium Migration Involving C-H Activation, Followed by Intramolecular Amination: Regioselective Synthesis of N1-Arylbenzotriazoles and an Evaluation of Their Inhibitory Activity Towards Indoleamine 2,3-Dioxygenase2014

    • 著者名/発表者名
      K. Takagi, M. Al-Amin, N. Hoshiya, J. Wouters, H. Sugimoto, Y. Shiro, H. Fukuda, S. Shuto, M. Arisawa
    • 雑誌名

      J. Org. Chem.

      巻: 79 ページ: 6366-6371

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-function Analyses of Cytochrome P450revI Involved in Reveromycin A Biosynthesis and Evaluation of the Biological Activity of Its Aubstrate, Reveromycin T2014

    • 著者名/発表者名
      S. Takahashi, S. Nagano, T. Nogawa, N. Kanoh, M. Uramoto, M. Kawatani, T. Shimizu, T. Miyazawa, Y. Shiro, H. Osada
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 289 ページ: 32446-32458

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Activation of Wild-type Cytochrome P450BM3 by the Next Generation of Decoy Molecules: Enhanced Hydroxylation of Gaseous Alkanes and Crystallographic Evidence2014

    • 著者名/発表者名
      Z. Cong, O. Shoji, C. Kasai, N. Kawakami, H. Sugimoto, Y. Shiro, Y. Watanabe
    • 雑誌名

      ACS Catalysis

      巻: 5 ページ: 150-156

    • 査読あり
  • [学会発表] Generation, Channeling and Decomposition of NO in Bacterial System2015

    • 著者名/発表者名
      Shiro, Y.
    • 学会等名
      “Metals in Biology” Gordon Research Conference
    • 発表場所
      Ventura, USA
    • 年月日
      2015-01-25 – 2015-01-30
    • 招待講演
  • [学会発表] これからの生物無機化学 ー金属タンパク質の過去と未来ー2014

    • 著者名/発表者名
      城 宜嗣
    • 学会等名
      第87回日本生化学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • 招待講演
  • [学会発表] Generation, Propagation and Decomposition of Nitric Oxide in Bacterial Denitrification2014

    • 著者名/発表者名
      Shiro, Y.
    • 学会等名
      18th European Bioenergetics Conference (EBEC 2014)
    • 発表場所
      Lisbon, Portugal
    • 年月日
      2014-07-12 – 2014-07-17
    • 招待講演
  • [学会発表] Bacterial Nitrite Reductase and Nitric Oxide Reductase; NO Generation, Channeling and Decomposition2014

    • 著者名/発表者名
      Shiro, Y.
    • 学会等名
      Eighth International Conference on Porphyrins and Phtalocyanines (ICPP8)
    • 発表場所
      Istanbul, Turky
    • 年月日
      2014-06-22 – 2014-06-27
    • 招待講演
  • [図書] 鉄の事典2014

    • 著者名/発表者名
      藤井 浩、城 宜嗣
    • 総ページ数
      820
    • 出版者
      朝倉書店
  • [備考] 理化学研究所 城生体金属科学研究室

    • URL

      http://www.riken.jp/biometal/index.htm

  • [備考] 兵庫県立大学 理学部 細胞制御Ⅱ研究室

    • URL

      http://www.sci.u-hyogo.ac.jp/life/regulation/index-j.html

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公開日: 2016-05-27  

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