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2016 年度 実績報告書

適応進化を考慮した気候変動下の遺伝的多様性予測モデルの開発

研究課題

研究課題/領域番号 26630247
研究機関愛媛大学

研究代表者

渡辺 幸三  愛媛大学, 理工学研究科(工学系), 准教授 (80634435)

研究分担者 風間 聡  東北大学, 工学研究科, 教授 (50272018)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード気候変動 / 適応進化 / 遺伝的多様性 / 河川生態系 / 選択性遺伝子座
研究実績の概要

課題1「気候変動後の流域環境の予測」では,名取川(宮城県)流域を対象とした気候変動モデルのダウンスケーリングを行い,複数のシナリオ(RCP2.6、RCP4.5、RCP8.5)下における降水量・気温を予測した.そして,分布型流出モデルを活用して流域内の流量(流速・水深)と水温の空間分布を予測した。
課題2「気候変動後の種の生息分布予測」では,課題1で算出された気候変動シナリオ下で予測される水温・流速・生息環境変数を説明変数として,対象種の個体群密度を目的変数とするmaximum-entropy approach (MaxEnt)モデルを作成し,気候変動シナリオ下の各種の対象流域内の生息可能な範囲を推定した。
課題3「流域環境と遺伝子の適応関係を定量化する連関モデルの開発」では,ゲノムワイドの遺伝子データからBayeScan解析およびニューラルネットワークモデルの自己組織化特徴マップ(SOM)を活用して環境選択性遺伝子座を同定した。そして,課題1で予測された水温・流量等の変数の中から,環境選択性遺伝子座と中立遺伝子座のそれぞれの遺伝子頻度と最も強い連関(相関)を示す環境変数を検索した。そして,各対立遺伝子頻度と連関が認められた環境変数の関係を表す重回帰モデルを作成した。
課題4「気候変動シナリオ下の流域内の遺伝的多様性の将来予測」では,まず,課題1で予測されたRCPシナリオ下の環境変数値を入力し,課題2で導かれたMaxEntに基づいて,将来の種の生息分布域を予測した。また,同様に,課題3で導かれた環境と対立遺伝子頻度の連関モデルから,気候変動下の環境選択性遺伝子座と中立遺伝子座の遺伝的多様性の空間分布と流域全体の遺伝的多様性を予測した。その結果、環境選択性遺伝子座よりも中立遺伝子座の方が遺伝的多様性の劣化がより著しいことが予想された。

  • 研究成果

    (29件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 3件、 査読あり 7件、 謝辞記載あり 7件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (16件) (うち国際学会 5件) 備考 (1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] ライプニッツ淡水生態学。内水漁業研究所(ドイツ)

    • 国名
      ドイツ
    • 外国機関名
      ライプニッツ淡水生態学。内水漁業研究所
  • [国際共同研究] 釜山大学校/Kyung Hee Univerisity(韓国)

    • 国名
      韓国
    • 外国機関名
      釜山大学校/Kyung Hee Univerisity
  • [国際共同研究] ハンガリー自然史博物館/ハンガリー科学アカデミー植物保護研究所(ハンガリー)

    • 国名
      ハンガリー
    • 外国機関名
      ハンガリー自然史博物館/ハンガリー科学アカデミー植物保護研究所
  • [国際共同研究] デラサール大学(フィリピン)

    • 国名
      フィリピン
    • 外国機関名
      デラサール大学
  • [雑誌論文] Comparative Tests of Species-Genetic Diversity Correlations in Neutral and Non-neutral Loci in Four Species of Stream Insect2017

    • 著者名/発表者名
      Kozo Watanabe and Michael T Monaghan
    • 雑誌名

      Evolution

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • DOI

      10.1111/evo.13261

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] New species and records of Leuctridae (Plecoptera) from Guangxi, China, on the basis of morphological and molecular data, with emphasis on Rhopalopsole2017

    • 著者名/発表者名
      Weihai Li, David Muranyi, Maribet Gamboa, Ding Yang, and Kozo Watanabe
    • 雑誌名

      Zootaxa

      巻: 4243 (1) ページ: 165-176

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.11646/zootaxa.4243.1.8

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Catchment Scale Modeling of Riverine Species Diversity Using Hydrological Simulation: Application to Tests of Species-Genetic Diversity Correlation2017

    • 著者名/発表者名
      Kei Nukazawa, So Kazama, and Kozo Watanabe
    • 雑誌名

      Ecohydrology

      巻: 10 ページ: e1778

    • DOI

      10.1002/eco.1778

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 次世代シーケンス解析による瀬切れ河川の水生昆虫複数種を対象とした流域内交流パターンの網羅的評価2016

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,泉昴佑,三宅洋,渡辺幸三
    • 雑誌名

      土木学会論文集G(環境)

      巻: Vol. 72, No. 7 ページ: III_489-III_496

    • DOI

      http://doi.org/10.2208/jscejer.72.III_489

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] メタバーコーディングを活用した排砂バイパスダム上下流間の河川底生動物の群集構造の評価2016

    • 著者名/発表者名
      渡辺幸三,近藤俊介,泉昂佑,八重樫咲子
    • 雑誌名

      土木学会論文集G(環境)

      巻: Vol. 72, No. 7 ページ: III_559-III_566

    • DOI

      http://doi.org/10.2208/jscejer.72.III_559

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Identification of Outlier Loci Responding to Anthropogenic and Natural Selection Pressure in Stream Insects Based on a Self-Organizing Map2016

    • 著者名/発表者名
      Bin Li, Kozo Watanabe, Dong-Hwan Kim, Sang-Bin Lee, Muyoung Heo, Heui-Soo Kim and Tae-Soo Chon
    • 雑誌名

      Water

      巻: 8(5) ページ: 188

    • DOI

      10.3390/w8050188

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Characterization of Genes Coding for Histone H3, 18S rRNA, and Cytochrome oxidase subunit I of East Asian Mayflies (Ephemeroptera)2016

    • 著者名/発表者名
      Kei Wakimura, Yasuhiro Takemon, Atsushi Takayanagi, Shin-ichi Ishiwata, Kozo Watanabe, Kazumi Tanida, Nobuyoshi Shimizu, and Mikio Kato
    • 雑誌名

      DNA Barcodes

      巻: 4 ページ: 1 - 25

    • DOI

      https://doi.org/10.1515/dna-2016-0001

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 次世代シーケンサーで得られた水性昆虫DNA配列の種判別2017

    • 著者名/発表者名
      稲井公二,渡辺幸三,加藤幹男
    • 学会等名
      日本陸水学会近畿支部会第28回研究発表会
    • 発表場所
      神戸学院大学(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2017-03-18 – 2017-03-18
  • [学会発表] 流出解析を利用した河川無脊椎生物の生息分布予測モデルの開発2017

    • 著者名/発表者名
      糠澤桂,風間聡,渡辺幸三
    • 学会等名
      第51回日本水環境学会年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本県・熊本市)
    • 年月日
      2017-03-15 – 2017-03-15
  • [学会発表] METABARCODING ANALYSIS OF WATER ENVIRONMENTAL DNA TO REVEAL SPECIES DIVERSITY OF AQUATIC INSECTS USING NEXT GENERATION SEQUENCING2017

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Kozo WATANABE
    • 学会等名
      The Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO) 2017 Aquatic Science Meeting
    • 発表場所
      Honolulu,USA
    • 年月日
      2017-03-10 – 2017-03-10
    • 国際学会
  • [学会発表] メタバーコーディングを活用した排砂バイパスダム上下流間の河川底生動物の群集構造の評価2016

    • 著者名/発表者名
      渡辺幸三,近藤俊介,泉昂佑,八重樫咲子
    • 学会等名
      第53回環境工学フォーラム
    • 発表場所
      北九州国際会議場(福岡県・北九州市)
    • 年月日
      2016-12-08 – 2016-12-08
  • [学会発表] 国際テータベースに登録された水生昆虫DNAの整理と検証2016

    • 著者名/発表者名
      稲井公二,渡辺幸三,加藤幹男
    • 学会等名
      日本陸水学会第81回大会
    • 発表場所
      琉球大学(沖縄県・沖縄市)
    • 年月日
      2016-11-06 – 2016-11-06
  • [学会発表] 水生昆虫DNAによる種判別システムの構築2016

    • 著者名/発表者名
      稲井公二,渡辺幸三,加藤幹男
    • 学会等名
      日本陸水学会第81回大会
    • 発表場所
      琉球大学(沖縄県・沖縄市)
    • 年月日
      2016-11-06 – 2016-11-06
  • [学会発表] 生息場モデルを用いた河川健全度予測手法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      糠澤桂,風間聡,渡辺幸三
    • 学会等名
      土木学会第71回年次学術講演会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-09-17 – 2016-09-17
  • [学会発表] 水文・生息場モデルを用いた河川健全度評価手法の提案2016

    • 著者名/発表者名
      糠澤桂,風間聡,渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第20回大会
    • 発表場所
      東京大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2016-09-03 – 2016-09-03
  • [学会発表] 日本の気候勾配に沿ったオナシカワゲラ(Nemoura sp.)個体群の比較プロテオーム解析2016

    • 著者名/発表者名
      山野俊介,Maribet Gamboa,Maria Claret Lauan,岩田久人,渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第20回大会
    • 発表場所
      東京大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2016-09-03 – 2016-09-03
  • [学会発表] 河川水中に存在するDNAを活用した重信川の流域内水生昆虫種多様性解析2016

    • 著者名/発表者名
      八重樫咲子,渡辺幸三
    • 学会等名
      応用生態工学会第20回大会
    • 発表場所
      東京大学(東京都・文京区)
    • 年月日
      2016-09-03 – 2016-09-03
  • [学会発表] Multispecies assessments of effects of habitat fragmentations on population genetic structures of stream invertebrates using next-generation sequencing2016

    • 著者名/発表者名
      Sakiko YAEGASHI, Kozo WATANABE
    • 学会等名
      20th Congress of the Asia Pacific Division of the International Association for Hydro Environment Engineering & Research
    • 発表場所
      Colombo, Sri Lanka
    • 年月日
      2016-08-29 – 2016-08-29
    • 国際学会
  • [学会発表] Gene-environmental association of stoneflies across environmental gradients in Japan2016

    • 著者名/発表者名
      Maribet Gamboa, Kozo Watanabe
    • 学会等名
      3rd International symposium of Benthological Society of Asia
    • 発表場所
      Vladivostok, Rusia
    • 年月日
      2016-08-04 – 2016-08-04
    • 国際学会
  • [学会発表] Different ways of sperm transfer among the Capniidae (plecoptera), and its importance in the generic system of the family2016

    • 著者名/発表者名
      D. Muranyi, W.H. Li, M. Gamboa, K. Watanabe
    • 学会等名
      3rd International symposium of Benthological Society of Asia
    • 発表場所
      Vladivostok, Rusia
    • 年月日
      2016-08-04 – 2016-08-04
    • 国際学会
  • [学会発表] Predicting Biodiversity of Aquatic Insects Under Changing Climates in Japan, and a Vision for Habitat Modeling of Dengue Vectors2016

    • 著者名/発表者名
      Nukazawa, K., Kazama, S., Watanabe, K.
    • 学会等名
      Dengue & Urban Climate Symposium
    • 発表場所
      Manila, Philippines
    • 年月日
      2016-07-07 – 2016-07-07
    • 国際学会
  • [学会発表] 次世代シークエンシングを用いた河川昆虫カワゲラの日本列島の気候勾配に沿った発現変動遺伝子の探索2016

    • 著者名/発表者名
      後藤友亮,Maribet Gamboa,渡辺幸三
    • 学会等名
      平成28年度四国支部技術研究発表会
    • 発表場所
      高知工科大学(高知県・香美市)
    • 年月日
      2016-05-28 – 2016-05-28
  • [学会発表] 日本の気候勾配に沿ったオナシカワゲラ(Nemoura.sp)のタンパク質発現パターンの多様性2016

    • 著者名/発表者名
      山野俊介,Maribet Gamboa,渡辺幸三
    • 学会等名
      平成28年度四国支部技術研究発表会
    • 発表場所
      高知工科大学(高知県・香美市)
    • 年月日
      2016-05-28 – 2016-05-28
  • [備考] ゲノム・生態学・モデリングに関する合同セミナー

    • URL

      https://sites.google.com/a/kw-laboratory.com/main/blog/20170201

  • [学会・シンポジウム開催] Joint seminar on Genetics, Ecology and Modelling in Freshwater Ecosystem2017

    • 発表場所
      愛媛大学
    • 年月日
      2017-02-01 – 2017-02-01

URL: 

公開日: 2018-01-16  

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