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2016 年度 実績報告書

シントロフィーを促進するサポーター微生物の存在とその新規微生物間相互作用の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26630250
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

成廣 隆  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 主任研究員 (20421844)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード微生物ゲノム / 嫌気共生細菌 / メタン生成菌
研究実績の概要

今年度は、メタン生成環境の代表例として、汚泥消化タンクなどに代表される嫌気性廃水処理プロセスを対象とし、シントロフィーによる有機物分解を担う嫌気性共生細菌(シントロフ)とメタン生成アーキア、およびシントロフィーを促進していることが推定されるBacteroidetes、Chloroflexi、Spirochaetes、Synergistetes、Thermotogae等の嫌気性微生物群の代謝機能をゲノム・メタゲノム解析により明らかにすることを試みた。前年度までに実施した酪酸等の脂肪酸を分解することが知られているSyntrophomonadaceae科の3種の微生物の比較ゲノム解析によって得られた情報を基盤とし、シントロフィーによる有機物分解を支える各種ヒドロゲナーゼ、ギ酸デヒドロゲナーゼ、および電子伝達フラボプロテイン酸化型ヒドロゲナーゼ複合体(Fix)、フェレドキシン:NAD酸化還元酵素複合体(Rnf)、フラビン酸化還元酵素-ヘテロS-S結合還元酵素複合体(Flox-Hdr)等のエネルギー保存系をコードする遺伝子群を、Syntrophomonas、Pelotomaculum、Syntrophorhabdus等に近縁のシントロフのメタゲノム情報から見出した。その結果、これらの代謝機能がシントロフィーの促進と維持に重要な役割を果たしていることが示唆された。また、メタン生成アーキアの比較ゲノム解析では、メタン生成反応の各段階を触媒する酵素遺伝子のシンテニーを比較し、Methanomicrobiaceae科に属するMethanoculleusやMethanofollisなどの水素利用メタン生成アーキアが、メタン生成に必要な一連の酵素遺伝子をゲノム上に連続して配していることが明らかとなり、シントロフ-メタン生成菌のペアリング形成にとって有利に働いていることが示唆された。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2017 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] イリノイ大学(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      イリノイ大学
  • [雑誌論文] Genomics and Metagenomics in Microbial Ecology: Recent Advances and Challenges2017

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Kamagata Y
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 32 ページ: 1-4

    • DOI

      doi: 10.1264/jsme2.ME3201rh

    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparative Genomics of Syntrophic Branched-Chain Fatty Acid Degrading Bacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Sekiguchi Y, Liu WT
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 31 ページ: 288-292

    • DOI

      doi: 10.1264/jsme2.ME16057

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Comparative genomics of branched-chain fatty acid degrading syntrophs reveals multiple genes involved in β-oxidation and energy conservation system2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Sekiguchi Y, Liu WT
    • 学会等名
      16th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      モントリオール国際会議場, モントリオール, カナダ
    • 年月日
      2016-08-21 – 2016-08-26
    • 国際学会

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公開日: 2018-01-16   更新日: 2022-02-16  

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