| 研究課題/領域番号 |
26640112
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
左子 芳彦 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (60153970)
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| 研究分担者 |
吉田 天士 京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (80305490)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| キーワード | 古細菌ゲノム / ゲノム進化 / ウイルスメタゲノム / 比較ゲノム / 超好熱菌 |
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| 研究実績の概要 |
Aeropyrum属古細菌は、浅海・深海熱水孔より世界に先駆けて見出した超好熱古細菌である。本研究では、本古細菌をモデルとして、3つの超生物界の一角を担う古細菌において、ウイルスによって駆動されるゲノム進化過程を解明する。今年度の成果は以下のとおりである。
１）鹿児島県山川温泉・長崎県小浜温泉や橘湾より計本属古細菌47株分離した。うち10株のドラフトゲノムを得た。ゲノム類似度比較解析により、本菌は地域的なバリエーションがあることが明らかとなった。
２）ゲノム上のウイルス耐性遺伝子領域と環境に存在する多様なウイルス由来配列（ウイルスメタゲノム）を比較することにより、地域ごとで本菌と相互作用するウイルス群集が異なる可能性を示した。
３）本菌の培養株1株より球状かつ既報のウイルスとはゲノムコンテクストが全く異なる新規溶原ウイルスを見出した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
予定の通りいくつかの地点から本種株を分離し、ゲノムを解読することに成功した。また、新規の本菌溶原ウイルスを発見し初年度から大きな成果があった。ただし、目標としていた30株のゲノム解読にまでは至らなかったため上記の評価にとどめた。
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| 今後の研究の推進方策 |
本年度も引き続き新規分離株の取得とゲノム解読を進める。ウイルス感染履歴各株の地域性に基づくゲノム多型とウイルス感染履歴という上記で得られる情報を整理し、本属古細菌の祖先型からゲノム多様性が生じた過程を予測する。前年度新たに見出した本種ウイルスのゲノムを含む性状解析を進める。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
今年度は研究初年度であるため、主に超好熱古細菌やウイルスの分離を行うことに多くの時間を費やした。そのため分離後に行うゲノム解析における高額なDNAシーケンス等への試薬の支払いが予定より少なかったため次年度使用額が生じた。
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| 次年度使用額の使用計画 |
今年度は、鹿児島県山川熱水環境より再度試料採取を行ってより多くの分離株の取得に努め、さらに単離した株の全ゲノムのDNAシーケンスを行って、詳細なゲノム解析を進めていく予定である。そのため、旅費、培養関連試薬、DNAシーケンス関係の試薬の購入に経費を使用する予定である。
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