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タンパク質は鎖状の分子であるが，それが立体的に正しく折り畳まれてはじめて機能を持つ．高等動植物のタンパク質が折り畳まれるには，真核細胞特有のシャペロニンが必要であるが，大腸菌にはこれが無い．ヒトや植物のタンパク質を大腸菌に自在に合成させる技術の確立を目指して，関連技術と理論について研究した．まず，大腸菌に真核型シャペロニンを含む多数の遺伝子を同時導入するために便利なDNA構築法を開発した．次に，遺伝子そのものを大腸菌で効率よく発現するよう最適化する際に研究者が自分で合理的に塩基配列を微調整できる方法を開発した．さらに，大腸菌で複数の遺伝子が発現するときの相対発現量に関する理論を構築した．
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