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2015 年度 実績報告書

1分子 VoV1 によるプロトン輸送の測定

研究課題

研究課題/領域番号 26650039
研究機関京都産業大学

研究代表者

横山 謙  京都産業大学, 総合生命科学部, 教授 (70271377)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
キーワードV-ATPase / ATP synthase / proton pump / molecular motor / rotation
研究実績の概要

VoV1 は、ATPを分解して得られる回転力を膜内在性のVo部分にある回転子(ローターリング)に伝え回転させることでプロトンを輸送する。V1部分で3分子の ATPを分解すると、回転子が一回転することから、ATP1分子の分解で輸送されるプロトンの数 (proton/ATP ratio, P/A 比)は、ローターリングにあるプロトン結合部位の3分の1と予想される。これは、V1 と Vo 間のエネルギー共役が ‘tight’ であることが前提である。しかしながら VoV1 のプロトン輸送活性の実測値がないことから、実験値に基づくP/A 比は不明であった。
本研究では、極微小体積のチャンバー上に貼った脂質二重膜上に VoV1 を再構成し、チャンバー内に閉じ込めた pH 指示薬の蛍光強度変化を測定することで1分子 VoV1 のプロトン輸送活性の測定を試みた。ATP依存的な蛍光強度変化は観察されたものの、プロトン輸送活性に換算すると非常に低く、P/A 比は理論値である 4 に比べ低くなった。これは、チャンバーと膜との密閉性が低く、プロトンのリークがあることが原因と考えられる。
そこで、リポソームに VoV1 を再構成し、リポソームを構成する脂質分子に蛍光指示薬である pHrode を結合させた系を用いてプロトンポンプ活性を測定した。この系では溶液中に蛍光指示薬がなくバックグランドの蛍光を低くすることができる。さらに、直径が揃ったリポソームを作成すること、緩衝液や酵素によるpH変化に対する緩衝能を見積もった理論式を使うことで、プロトン輸送速度を見積もった。その結果、概ね P/A 比は 3-4 の間になった。初めて 実験的に求められた VoV1 の P/A 比であり、この結果、V1 と Vo 間のエネルギー共役が tight であることが実験的に示された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 3件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The ingenious structure of central rotor apparatus in VoV1; key for both complex disassembly and energy coupling between V1 and Vo2015

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi A., Kishikawa J., Tamakoshi, M., Yokoyama K.
    • 雑誌名

      PLos one

      巻: 10 ページ: e0119602-

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0119602

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] GraDeR: Membrane Protein Complex Preparation for Single- Particle Cryo-EM2015

    • 著者名/発表者名
      Hauer F, Gerle C, Fischer N, Oshima A, Shinzawa-Itoh K, Shimada S Yokoyama K, Fujiyoshi Y, Stark H
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 15 ページ: 291-299

    • DOI

      10.1016/j.str.2015.06.029.

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] V-ATPase の H+/ATP 比の測定2015

    • 著者名/発表者名
      平田かえで、岸川淳一、中西温子、木下一彦、飯田直樹、 横山謙
    • 学会等名
      BMB 2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • 国際学会
  • [学会発表] Single particle analysis of Thermus thermophilus V-ATPase using an electron microscopy ATPase/synthase2015

    • 著者名/発表者名
      Atsuko Nakanishi, Nao Takeuchi, Jun-ichi Kishikawa,Kaoru Mistuoka, Ken Yokoyama
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県 金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
    • 国際学会
  • [学会発表] Torque generation mechanism in V1 motor2015

    • 著者名/発表者名
      BaBa Mihori,Jun-ichi Kishikawa, Atsuko Nakanishi, Nao Takeuchi, Shou Furuike, Ken Yokoyama
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県 金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
    • 国際学会
  • [備考] Ken Yokoyama Lab

    • URL

      http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~yokoken/index-j.htm

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公開日: 2017-01-06  

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