CRISPRiシステムを用いたシス制御領域の新規機能解析法の確立

2016 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 26650087
• 研究機関: 沖縄科学技術大学院大学
• 研究代表者: 安岡 有理 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70724954)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• キーワード: ゲノム編集 / 発生 / シス制御領域 / 転写制御関連因子

研究実績の概要

ツメガエル胚に対してmRNAを顕微注入する代わりに、dCas9およびCas9タンパク質を各種gRNAとともに顕微注入し、ルシフェラーゼレポーター解析によってその効果を検討した。その結果、Cas9タンパク質を注入した場合はレポーターの発現が阻害されたものの、dCas9タンパク質では阻害されなかった。この結果は、Cas9タンパク質によってレポーターDNAが切断されればレポーターの発現量が下がるものの、dCas9タンパク質が結合するだけでは、内在の転写制御タンパク質によって押し出され、阻害効果をもたらさないことを意味している。したがって、dCas9を用いたシス制御領域の機能解析実験は、少なくともツメガエル胚では有効な手段となりえないことが示された。

研究成果

• [雑誌論文] Foxh1 Occupies cis-Regulatory Modules Prior to Dynamic Transcription Factor Interactions Controlling the Mesendoderm Gene Program. (2017)
  • 著者名/発表者名: Rebekah M. Charney, Elmira Forouzmand, Jin Sun Cho, Jessica Cheung, Kitt D. Paraiso, Yuuri Yasuoka, Shuji Takahashi, Masanori Taira, Ira L. Blitz, Xiaohui Xie, and Ken W.Y. Cho.
  • 雑誌名: Developmental Cell 巻: 40 ページ: 595-607
  • DOI: 10.1016/j.devcel.2017.02.017.
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] The chordate ancestor possessed a single copy of the Brachyury gene for notochord acquisition. (2017)
  • 著者名/発表者名: Inoue, J., Yasuoka, Y., Takahashi, H., & Satoh, N.
  • 雑誌名: Zoological Letters 巻: 3 ページ: 4
  • DOI: 10.1186/s40851-017-0064-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis (2016)
  • 著者名/発表者名: Adam M. Session, Yoshinobu Uno, Taejoon Kwon, ….., Yuuri Yasuoka, ….., Richard M. Harland, Masanori Taira, Daniel S. Rokhsar （全74名中55番目）
  • 雑誌名: Nature 巻: 538 ページ: 336-343
  • DOI: 10.1038/nature19840
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The mesoderm-forming gene, brachyury, regulates ectoderm-endoderm demarcation in a diploblast, the coral, Acropora digitifera (2016)
  • 著者名/発表者名: Yuuri Yasuoka, Chuya Shinzato, and Noriyuki Satoh
  • 雑誌名: Current Biology 巻: 26 ページ: 2885-2892
  • DOI: 10.1016/j.cub.2016.08.011.
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] 脊椎動物におけるBrachyuryの遺伝子重複がもつ 進化的意義 (2016)
  • 著者名/発表者名: 安岡有理
  • 学会等名: 第10回日本ツメガエル研究集会
  • 発表場所: OISTシーサイドハウス（沖縄県国頭郡恩納村）
  • 年月日: 2016-11-19
• [学会発表] The mesoderm-forming gene, brachyury, regulates ectoderm-endoderm demarcation in a diploblast, the coral, Acropora digitifera (2016)
  • 著者名/発表者名: Yuuri Yasuoka, Chuya Shinzato, and Noriyuki Satoh
  • 学会等名: 第22回国際動物学会議・第87回日本動物学会合同大会
  • 発表場所: 宜野湾コンベンションセンター（沖縄県宜野湾市）
  • 年月日: 2016-11-17 – 2016-11-18
  • 国際学会