| 研究課題/領域番号 |
26650143
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| 研究機関 | 立教大学 |
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研究代表者 |
榊原 恵子 立教大学, 理学部, 准教授 (90590000)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2018-03-31
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| キーワード | ツノゴケ / 陸上植物 / 胞子体進化 / 形質転換系 / ゲノムシークエンス |
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| 研究実績の概要 |
陸上植物の胞子体拡大進化をもたらした分子基盤の解明のために、他のコケ植物と維管束植物の中間的な胞子体形態を持つコケ植物ツノゴケの発生進化研究モデルの確立を目的として研究を進めてきた。
平成27年度までに１．ツノゴケ類のAnthoceros agrestisを用いて実験環境下において３ヶ月程度で全生活環を再現できる培養系を確立し、２．Anthoceros agrestisの配偶体の再生過程にアグロバクテリウムを感染させることで安定形質転換体の作出に成功した。３．安定形質転換体の選抜に用いることのできる薬剤を決定した。４．胞子体特異的に発現する遺伝子を探索するために、配偶体と胞子体のRNAシークエンスを行う予定であったが、配偶体世代の葉状体及び造精器のRNAシークエンスとペアエンドライブラリーによるゲノムシーケンスを実施した。
平成28年度は金沢大学学際科学実験センターの西山智明博士によるゲノムシークエンスの解析により、131.6 Mbのアセンブリーが得られ、Anthoceros agrestisゲノム中に約25442個の遺伝子が予測された。他のコケ植物で知られている胞子体発生遺伝子であるKNOX遺伝子、LFY遺伝子、及びWOX遺伝子がAnthoceros agrestisゲノム中に複数個存在することがわかった。若い胞子体と胞子体のRNAシークエンスライブラリーを調整し、平成28年度中にシークエンスを実施する予定であったが、予定が遅れている。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
平成28年4~6月に産前産後休業を取得したため、研究を中断した。平成28年４月に異動のため研究実施場所を変更したため、研究環境整備に時間を要した。
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| 今後の研究の推進方策 |
平成28年度に実施できなかった胞子体のRNAシークエンスを完了し、これまでのRNAシークエンス情報をふまえて胞子体特異的に発現する遺伝子を選抜する。
これまでに他のコケ植物で知られている胞子体発生遺伝子であるKNOX遺伝子、LFY遺伝子とあわせて機能解析を行う。
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| 次年度使用額が生じた理由 |
平成28年度の産休を取得したため研究を中断し、研究実施場所を変更したため、研究の遂行が遅れた。
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| 次年度使用額の使用計画 |
平成28年度実施する予定であった胞子体のRNAシークエンスとPacBioによるゲノムシークエンスを実施する。
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