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2016 年度 実績報告書

One Fungus One Name に対応した酵母の分類体系の完成

研究課題

研究課題/領域番号 26650148
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

高島 昌子  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソースセンター, ユニットリーダー (20333304)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード系統樹 / 酵母分類学 / Trichosporonales / ハラタケ亜門 / ゲノム分類
研究実績の概要

Trichosporonales目のゲノム系統樹を作成した。ゲノム解析を行った中で、Trichosporon coremiiforme, T. ovoides, Cutaneotrichosporon mucoidesはハイブリッドゲノムであったため、これらついてはサブゲノムを構築して系統樹作成に用いた。新規解析株を含む本目27種、及び外群として3種のドラフトゲノムデータを用い、オーソロガス遺伝子を連結し約230万塩基に基づく最尤系統樹を作成した。得られた系統樹ではすべての枝が100%のbootstrap値を示し、信頼度の高い系統樹であった。また、Liuらの解析では明らかになっていなかった2つの新属候補の存在が明らかになった。さらに、かつてTrichosporon属と分類されていたApiotrichum属、Cutaneotrichosporon属、およびTrichosporon属の3属のコア遺伝子を調べたところ、Apiotrichum属のみが共通に有する遺伝子は27、およびTrichosporon属のみが共通に有する遺伝子は263が得られた。本結果は、Apiotrichum属およびTrichosporon属は共通遺伝子を用いての特徴付けが行える菌群であることを示しており、ゲノム分類に貢献する。なお、新規のゲノム解析も行い、ゲノムデータの充実を図った。
淡路島で開催された国際学会14th International Congress on Yeasts (ICY14)において、酵母の分類のセッションをオーガナイズし、シンポジウムで発表をおこなった。さらにICY14では、命名に関するワークショップも開催し、One Fungus One Nameに関する議論を行った。また、日本微生物資源学会第23回大会、第60回日本医真菌学会総会・学術集会、および第11回日本ゲノム微生物学会において、受賞講演、シンポジスト、ポスター発表等を行った。
現在国際コミュニティーでは、2015年に提案されたCryptococcus neoformans-C. gattiiの再分類に関して、賛成と反対の両立場から議論が行われており、これに参加している。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (2件) (うち謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] 病原性酵母の分類の現状 ―担子菌酵母CryptococcusとTrichosporonについて―2017

    • 著者名/発表者名
      杉田隆、張音実、高島昌子
    • 雑誌名

      Medical Mycology Journal

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

  • [雑誌論文] 酵母の種多様性解析に基づく分類体系の再構築とゲノム分類手法の導入2016

    • 著者名/発表者名
      高島昌子
    • 雑誌名

      Microb. Resource. Syst.

      巻: 32 ページ: 97-103

    • 謝辞記載あり
  • [学会発表] ゲノムデータに基づく Trichosporonales 目の系統解析2017

    • 著者名/発表者名
      高島昌子、Sira Sriswasdi、西村祐貴、眞鍋理一郎、杉田隆、遠藤力也、岩崎渉、大熊盛也
    • 学会等名
      第11回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス(神奈川県藤沢市)
    • 年月日
      2017-03-02 – 2017-03-03
  • [学会発表] 病原真菌等120株のドラフトゲノムの公開とこれに基づくTrichosporon属の全ゲノム系統樹2016

    • 著者名/発表者名
      高島昌子、杉田隆
    • 学会等名
      第60回日本医真菌学会総会・学術集会
    • 発表場所
      東京都立産業貿易センター台東館(東京都台東区)
    • 年月日
      2016-10-01
    • 招待講演
  • [学会発表] Upgrading a sequence-based yeast classification system: A genome-wide phylogenetic study of the order Trichosporonales.2016

    • 著者名/発表者名
      Masako Takashima, Ri-ichiroh Manabe, Sira Sriswasdi, Wataru Iwasaki, Rikiya Endoh, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita
    • 学会等名
      14th International Congress on Yeasts
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議センター(兵庫県淡路市)
    • 年月日
      2016-09-14
    • 国際学会
  • [学会発表] 担子菌系酵母のThe Yeasts 第5版以降の分類体系変更の概要2016

    • 著者名/発表者名
      高島昌子、遠藤力也、大熊盛也
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第23回大会
    • 発表場所
      千葉大学けやき会館(千葉県千葉市)
    • 年月日
      2016-07-05
  • [学会発表] 酵母の多様性および分類学的研究とそれに基づくゲノム情報の整備2016

    • 著者名/発表者名
      高島昌子
    • 学会等名
      日本微生物資源学会第23回大会
    • 発表場所
      千葉大学けやき会館(西千葉キャンパス)
    • 年月日
      2016-07-05

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公開日: 2018-01-16  

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