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2015 年度 実施状況報告書

次世代シークエンシング技術を利用したマメガキおよびカキの雌雄性制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26660025
研究機関京都大学

研究代表者

田尾 龍太郎  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (10211997)

研究分担者 河井 崇  京都大学, (連合)農学研究科(研究院), 助教 (90721134)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード果樹 / 園芸 / 雌雄異株性
研究実績の概要

本研究では,従来の研究手法のみの利用では,さらなる研究の進展に限界があり,研究の発展が阻まれているマメガキの雌雄性研究に,近年,急速な進歩を遂げた次世代シークエンシング技術を導入することでブレークスルーをはかり,マメガキ(Diospyros lotus)の雌雄性決定因子を同定し,その結果を栽培カキ(D. kaki)の雌雄性研究に応用しようとするものである.昨年度までの研究で,マメガキの雌雄決定機構が明確になったので,研究2年目にあたる本年は栽培ガキの研究を進め,以下の実験結果を得た.
① マメガキの雄性決定遺伝子であるOGI遺伝子が,栽培器の雌雄性と関連性があるかどうか,マメガキのOGI配列を参考にPCR増幅用のプライマーを作製し調査した.
② 栽培ガキのOGI配列とMeGI配列をクローニングして,マメガキの配列と比較した.
③ 栽培ガキのsmall RNA-Seq解析とOGIとMeGI配列のメチル化解析を行った.

現在までの達成度
現在までの達成度

1: 当初の計画以上に進展している

理由

マメガキの性決定領域が予想より小さかったことや次世代シークエンシング技術が予想以上にうまく機能したことから,既にマメガキにおける雌雄異株性の決定機構の解明に成功しており,栽培ガキの解析も順調に進んでいる.

今後の研究の推進方策

当初の計画以上の研究進展をみており,栽培ガキの雌雄性の制御機構の解明にも予定より早く着手できている.今後,栽培ガキの雌雄性の制御機構の解明に鋭意取り組む予定である.

次年度使用額が生じた理由

実験計画の一部が,当初の予定より効率的に行うことが可能であったため,次年度使用額が生じた.

次年度使用額の使用計画

さらに研究の進展を早めるために,研究3年度目に予定していた研究をさらに充実させるために使用する.

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] マメガキ(Diospyros lotus L.)で同定された雄性決定因子連鎖領域とカキ(D. kaki Thunb.)品種の雄花着生特性との関連性2015

    • 著者名/発表者名
      梶田啓・赤木剛士・山根久代・田尾龍太郎・米森敬三
    • 雑誌名

      園学研

      巻: 14 ページ: 103-113

    • DOI

      doi: 10.2503/hrj.14.121

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] カキの性決定2015

    • 著者名/発表者名
      赤木剛士・田尾龍太郎
    • 雑誌名

      果実日本

      巻: 71 ページ: 24-26

  • [学会発表] Evolution of a flexible sex determination system in polyploid persimmon.2016

    • 著者名/発表者名
      Akagi, T., I. M. Henry, R. Tao and L. Comai
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome Conference XXIII
    • 発表場所
      San Diego, California
    • 年月日
      2016-01-09 – 2016-01-13
    • 国際学会
  • [学会発表] Variation on a theme: diploid and hexaploid persimmon regulate sex in slightly different ways2016

    • 著者名/発表者名
      Henry, I. M., T. Akagi, R. Tao and L. Comai
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome Conference XXIII
    • 発表場所
      San Diego, California
    • 年月日
      2016-01-09 – 2016-01-13
    • 国際学会
  • [学会発表] Successful utilization of the nex-generation sequencing technologies to identify sex determinant in persimmons: A possible application for kiwifruit study2015

    • 著者名/発表者名
      Akagi, T. and R. Tao
    • 学会等名
      International Symposium on Genetic Bases for Kiwifruit Breeding
    • 発表場所
      Takamatsu, Japan
    • 年月日
      2015-12-09 – 2015-12-09
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Sexuality in Diospyros species2015

    • 著者名/発表者名
      Tao, R.
    • 学会等名
      Interrnational symposium of correlative gene system; Establishing next-generation genetics
    • 発表場所
      Nara, Japan
    • 年月日
      2015-05-29 – 2015-05-30
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 京都大学アカデミックデイ2015 -果樹のライフサイクル研究の最前線-

    • URL

      http://research.kyoto-u.ac.jp/academic-day/2015/19/

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公開日: 2017-01-06  

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