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2014 年度 実施状況報告書

カザフスタン在来馬を用いた家畜馬の起源に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 26660257
研究機関岡山大学

研究代表者

国枝 哲夫  岡山大学, その他の研究科, 教授 (80178011)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
キーワード在来馬 / カザフスタン / 遺伝的多様性 / マイクロサテライトマーカー / ミトコンドリアDNA
研究実績の概要

本研究では、これまでにカザフスタン在来馬の集団より採取したDNAサンプルを用いて、各種のDNA多型マーカーの解析を行うことで、これら集団の遺伝的特徴を解析し、他在来馬集団および既存品種の馬と比較することにより、本集団が他の家畜馬とは由来の異なる集団であるか否かを明らかとすることを目的とする。
本年度は、まずカザフスタン北部で飼育されている在来馬より得られたDNAサンプルについて、マイクロサテライトマーカー、ミトコンドリアDNAの多型の解析を行った。その結果、まず、マイクロサテライトマーカーの解析から、カザフスタン北部にて在来種とロシア等から導入された外来種の交雑により樹立されたコスタナイ種というカザフスタン在来馬の品種は他の中央アジアとは異なる遺伝的特徴を持つ可能性が示唆された。さらに、コスタナイ種を含めて主にカザフスタン北部地域から収集されたカザフスタン在来馬野DNAサンプルを用いてミトコンドリアDNA Dループ領域の塩基配列を決定し、データベース上に登録されている多くのウマミトコンドリアDNAの配列と比較したところ、カザフスタン在来馬には他の品種には見られない新たなミトコンドリアDNAハプロタイプが存在することが明らかとなった。以上の結果は、カザフスタン在来馬が他の品種とは異なる固有の遺伝的特徴を持つことを示唆している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

当初の研究計画通り、カザフスタン在来馬のDNAサンプルを用いてマイクロサテライトマーカー、ミトコンドリアDNAの解析を行い、カザフスタン在来馬の遺伝的特徴を明らかにしている。まだ、地域が限られているため、カザフスタン在来馬遺伝学的特徴の全体像を明らかにするには至っていないが、今後の進展により全体像を明らかにすることも可能と思われる。

今後の研究の推進方策

前年度に行ったカザフスタン北部の在来馬集団の遺伝学的解析に引き続き、本年度はカザフスタン南部および西部地域より収集したDNAサンプルを用いてマイクロサテライトマーカー、ミトコンドリアDNAの解析を行いこれらの集団の遺伝的特徴を明らかにする。さらに、これらの遺伝学的マーカーに加えてY染色体特異的DNAのハプロタイプの解析を行う。ミトコンドリアDNAが母系の遺伝的多様性を明らかとするのに対し、Y染色体のハプロタイプは父系の遺伝的多様性を明らかとすることから、両者を組み合わせることで、カザフスタン在来馬の遺伝的特徴をより正確に明らかにすることが可能と思われる。

次年度使用額が生じた理由

カザフスタン在来馬のサンプリングに遅れが生じ、本年度はカザフスタン北部地域の在来馬のサンプルの解析を中心に行い、その他の地域のサンプルの解析は十分にできなかったため、使用残額が生じた。

次年度使用額の使用計画

次年度以降、これらのサンプルを入手の後にこれらの解析のために使用する予定である。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] Allelic frequencies and association with carcass traits of six genes in local subpopulations of Japanese Black cattle.2015

    • 著者名/発表者名
      Nishimaki, T., Ibi, T.,Siqintuya, Kobayashi, N., Matsuhashi, T., Akiyama, T., Yoshida, E., Imai, K., Matsui, M., Uemura, K.,, Eto, H., Watanabe, N., Fujita, T., Saito, Y., Komatsu, T., Hoshiba, H., Mannen, H., Sasazaki, S., Kunieda, T
    • 雑誌名

      Anim. Sci. J.

      巻: 86 ページ: 未定

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 口之島牛集団における経済形質、遺伝性疾患および毛色に関連する遺伝子の対立遺伝子頻度とその分布2014

    • 著者名/発表者名
      斯琴図雅、西牧孝洋、揖斐隆之、辻 岳人、米田一裕、大島一郎、片平清美、万年英之、下桐 猛、印牧美佐生、国枝哲夫
    • 雑誌名

      動物遺伝育種研究

      巻: 42 ページ: 11 19

    • 査読あり
  • [学会発表] ミャンマー在来馬の遺伝学的特徴の解析2015

    • 著者名/発表者名
      奥田ゆう、青木実菜、Moe Hla Hla、Moe Kyaw Kyaw、西岡謙二、清水佑起、戸崎晃明、栫裕永、万年英之、下桐猛、印牧美佐生、国枝哲夫
    • 学会等名
      日本畜産学会第119回大会
    • 発表場所
      宇都宮
    • 年月日
      2015-03-27 – 2015-03-29
  • [学会発表] ミャンマー在来牛を用いたBos taurus 由来DNAマーカーの遺伝子型判定.2014

    • 著者名/発表者名
      Hla Hla Moe、奥田ゆう、Moe Lwin、Kyaw Kyaw Moe、河邊弘太郎、岡本新、印牧美佐生、万年 英之、国枝 哲夫、下桐 猛
    • 学会等名
      第15回日本動物遺伝育種学会大会
    • 発表場所
      和光
    • 年月日
      2014-10-31 – 2014-11-01
  • [学会発表] 口之島牛のウシ主要組織適合遺伝子複合体領域の(MHC)領域のゲノム多様性2014

    • 著者名/発表者名
      竹嶋伸之輔、細道一善、菊屋真理、Polat Meripet、下桐猛、印牧美佐生、万年英之、国枝哲夫、間陽子
    • 学会等名
      第15回日本動物遺伝育種学会大会
    • 発表場所
      和光
    • 年月日
      2014-10-31 – 2014-11-01
  • [学会発表] ウシ主要組織適合遺伝子複合体領域の(MHC)領域のゲノム多様性2014

    • 著者名/発表者名
      細道一善、竹嶋伸之輔、下桐猛、印牧美佐生、万年英之、国枝哲夫、井上逸朗、間陽子
    • 学会等名
      第15回日本動物遺伝育種学会大会
    • 発表場所
      和光
    • 年月日
      2014-10-31 – 2014-11-01

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公開日: 2016-05-27  

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