研究課題
前年度に解析が進んだ化合物Cについて、作用機序解析を実施した。これまでの研究により、化合物Cは黄色ブドウ球菌の高分子合成のうちRNA合成を特異的に阻害し、RNAポリメラーゼのσサブユニットをコードする遺伝子に変異を有する、独立した2つの耐性変異株を取得していた。さらに、ファージトランスダクション法によって、σサブユニットの変異が化合物に対する耐性獲得を起こすことを明らかにした。その株におけるRNA合成に対する化合物Cの効果を検討したところ、野生型はRNA合成が阻害されるのに対して、耐性変異株は薬剤を加えてもRNA合成が阻害されなかった。また、部分精製したRNAポリメラーゼの試験管内における活性についても、化合物Cは野生型由来のRNAポリメラーゼのプロモーターからの転写は阻害するが、変異株由来のものは耐性を示した。また、大腸菌のRNAポリメラーゼのコア酵素に、黄色ブドウ球菌の野生型と変異型のσサブユニットを加えてホロ酵素を形成させ、化合物Cに対する感受性について検討したところ、変異型は野生型に比べて試験管内転写活性は耐性を示した。さらに、化合物CはRNAポリメラーゼのσサブユニットに結合した。これらの結果から、化合物Cは、RNAポリメラーゼのσサブユニットを標的として抗菌活性を示していることが明らかになった。これまで、σサブユニットを標的とする小分子の抗菌化合物は知られておらず、本化合物は新しいメカニズムを有していると考えられる。
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